win11安装linux子系统ubuntu22.04+qiime2+使用Rstudio调用
1.win11安装linux子系统ubuntu22.04
1.1设置开发者模式
1.2打开子系统选项
1.3下载Ubuntu22.04
1.4输入用户名密码创建用户
输入自己的用户名密码创建用户
1.5Ubuntu子系统换源
自己百度解决吧,不过多赘述
2.Qiime2下载安装
2.1miniconda下载安装
自行百度找刘永鑫老师的推文有涉及到,也不过多赘述
2.2Qiime2下载安装
安装成功后,此电脑下面会出现linux系统目录,进入home,再进入自己创建的用户,新建文件夹2023.2存储qiime2安装文件
cd 2023.2
wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2023.2-py38-linux-conda.yml
conda env create -n qiime2-2023.2 --file qiime2-2023.2-py38-linux-conda.yml
其中2023.2-py38-linux-conda.yml也可以自行到网上下载然后放进2023.2文件夹,不使用wget这句代码获得
rm qiime2-2023.2-py38-linux-conda.yml
conda activate qiime2-2023.2#Activate the conda environment
qiime --help#Test your installation
3.结合Rstudio使用ubuntu
之后在terminal中输入wsl 进入Ubuntu子系统即可