Ubuntu 20.04+NVIDIA驱动+Cuda11.5+FTTW3.3.10+lammps GPU加速

整个过程录像文件：

ubuntu20.04部署lammps GPU加速，，，，AMD 7742双路搭载NVIDIA RTX 3090

1.Ubuntu操作系统安装：

开机选择EFI引导的U盘启动：

回车，进入到 

选择Install Ubuntu，

Normal installation

Erase disk and install Ubuntu

地区随便选择，然后Continue

输入用户名，密码信息后， Continue，接下来就是等，等等，等。

安装完成后，Restart Now，回车。机器重启。

2.安装NVIDIA驱动：

打开终端

sudo apt install openssh-server
sudo apt install vim gcc g++ make -y
sudo apt install vim
sudo vim /etc/modprobe.d/blacklist.conf

在blacklist.conf 末尾添加：

blacklist nouveau

保存退出，

sudo update-initramfs -u
sudo init 3
cd Downloads/        #我这里已经提前下载好驱动文件
sudo chmod 777 *
sudo ./NVIDIA-Linux-x86_64-470.86.run 

验证安装是否成功，

nvidia-smi

能显示如下GPU信息，安装成功。 

3.安装Cuda-11.5

cd Downloads/
sudo ./cuda_11.5.0_495.29.05_linux.run
accept  #等待一段时间后，输入，回车

sudo vim ~/.bashrc 

 在打开的文件末尾添加

export PATH=/usr/local/cuda-11.5/bin${PATH:+:${PATH}}
export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda-11.5/lib64${LD_LIBRARY_PATH:+:${LD_LIBRARY_PATH}}

保存退出，

source ~/.bashrc 
nvcc -v

输出以下信息。

Cuda安装完毕。

3.安装lammps：

cd Downloads/
tar -xvf fftw-3.3.10.tar.gz 
tar -xvf lammps-stable.tar.gz 
cd fftw-3.3.10/
sudo ./configure --prefix=/usr/local/ --enable-float 
sudo make -j 
sudo make install
cd
sudo apt install mpich
cd lammps-29Sep2021/lib/gpu/
sudo vim Makefile.linux

需要修改以下内容

CUDA_HOME = /usr/loca/cuda
修改为：
CUDA_HOME = /usr/loca/cuda-11.5


NVCC = nvcc
修改为：
NVCC = /usr/loca/cuda-11.5/bin/nvcc 
#一开始我没有修改nvcc路径，后面make Makefile.linux的时候一直报错

CUDA_ARCH = -arch=sm_50
修改为：
CUDA_ARCH = -arch=sm_86
#这里是需要根据实际GPU型号修改对应参数。

保存退出。

sudo make -f Makefile.linux -j
cd ..
cd src/
sudo make yes-gpu
#以下是我根据客户需求预先添加上的package
sudo make yes-class2
sudo make yes-kspace
sudo make yes-manybody
sudo make yes-molecule
sudo make yes-rigid
sudo make yes-meam


sudo make mpi -j

安装完成。下面用lammps文件自带的例子测试。

cd ..
cd examples/DIFFUSE/

/usr/bin/mpirun -np 20 /home/dongbing/Downloads/lammps-29Sep2021/src/lmp_mpi < in.msd.2d
#CPU 计算，其实这里完全可以用
mpirun -np 20 lmp_mpi < in.msd.2d
来执行，之前安装的时候因为有遇到过莫名的问题，所以我后来都用了绝对路径执行。
当然，这是我个人安装时的路径。可根据自身情况而定。


/usr/bin/mpirun -np 1 /home/dongbing/Downloads/lammps-29Sep2021/src/lmp_mpi -sf gpu -pk gpu 1 -in in.msd.2d
#GPU计算

写在最后：

折腾了好几天，现在总算是可以正常安装并运行了。不过一位大佬告诉我自带的例子体量太小，不具有代表性。

如果您手里有方便的例子或者您有需要用到机器，我可以免费提供，也好对自己的机器计算能力有个大致了解。

哦对了，本人是从事硬件方面的服务商，所以嘛，机器有很多闲置机器。