空间转录组数据分析之空间轨迹（Spatial tendency）

作者，Evil Genius

今天2024年5月21日，凌晨，也就是昨晚，又一个鲜活的生命在太原从桥上跳下。

往事不堪回首

今天我们来学习空间轨迹

空间轨迹包括空间基因轨迹和细胞轨迹、甚至包括CNV轨迹

关于空间轨迹也写了很多，列在下面

时空轨迹分析导论

空间转录组之空间基因和细胞轨迹

10X空间转录组数据分析之CNV轨迹层级

时空轨迹和空间细胞相互作用

与单细胞不同，单细胞轨迹主要是用来研究细胞的发育分化方向，但是空间轨迹主要是来研究TME，具体的做法就是研究某个区域随着距离的扩大，基因表达或者细胞含量的变化，如下图：

诸多文章用到了这个方法，以前在分享SPATA2的时候，有介绍到轨迹分析的内容，如下图：