最后一课准备----Xenium生态位与微环境分析

作者，Evil Genius

时间很快，马上要最后一课了。

生活总是很多不如意，但总是要往前走的，不是么。

我们已经讲了很多内容了，大家要灵活运用，所有分析都是自己慢慢总结出来的，也是和客户不断沟通，抓住客户分析痛点的一些总结。大家如果是自己课题组做了单细胞空间的测序，要自己分析的话，先要对数据有一个全面的了解，针对自己的数据设计一个大致的方案，不需要很细，有方向即可，然后依据课上的个性化分析点，有针对性的分析即可。

强调一下我不是专门做培训的人啊，也是不能以此为主业的，还是要做牛马的，所以我还是要认真做项目，大家以后如果跟我一样不再是一线的时候，个人前景和公司发展就基本绑定在一起了，只有公司有发展，个人才有前景，所以我们这些人都是想尽办法为公司带来业绩，我作为生信分析的角色，就是提供高质量的分析服务，满足客户的分析需求，客户如果认可分析能力，自然对业绩有帮助。

我的领导是国内浙江大学博士毕业，德国慕尼黑大学留学回国的，他经常强调的两点就是，一要有自信，这个主要体现在公司自我评测的时候，他不允许自我评价的时候自己都觉得自己不行，100分自己还要扣几分；第二点就是强调集体感，公司如果发展受阻，甚至倒退，个人还怎么体现价值？果然很有德国那种务实的作风，覆巢之下安有完卵。

原位数据（Xenium）最直观的分析，就是细胞的状态，例如空间分布和聚集程度

一般都是用网络结构来展示的

niche分析是任何空间数据，永恒的话题

细胞分割，离大家可能比较远，但离我很近，以后大家有可能会从事图像识别等方面的工作

邻域分析，也就是微环境分析，也是空间必做的分析点。

还有空间轨迹

现在来看，空间的文章发表的并不多，且几乎都是高分文章，visium大约500多篇，真正实验类的文章300多篇，HD没有，但是像华大这样的高精度平台也有大约不到100篇，高通量的原位，文章也很少，都是机会，如果大家手里有空间数据，并且需要分析发文章，绝对是极佳的机会。

生活很好，有你更好