Error in plot_genes_branched_heatmap(HSMM[row.names(subset(BEAM_res_1, : non-numeric argument to

R中用monocle画图plot_genes_branched_heatmap报错

p1=plot_genes_branched_heatmap(HSMM[row.names(subset(BEAM_res_1,
                                                     qval < 1e-4)),],
                               branch_point = 1,#绘制的是那个分支
                               num_clusters =5,#分成几个cluster,根据需要调整
                               cores = 2,
                               use_gene_short_name = T,
                            show_rownames = F,return_heatmap = TRUE)+labs(title="HCC_branch_point1")

试试删除+labs(title="HCC_branch_point1")

试试将 plot_genes_branched_heatmap中的参数num_clusters 改变,

运行成功

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