安装R包gwasvcf、gwasglue、plinkbinr、MVMR

安装plinkbinr

devtools::install_github("explodecomputer/plinkbinr")

报错：

Error: Failed to install 'unknown package' from GitHub:
  HTTP error 403.
  API rate limit exceeded for 206.237.119.148. (But here's the good news: Authenticated requests get a higher rate limit. Check out the documentation for more details.)

  Rate limit remaining: 0/60
  Rate limit reset at: 2024-12-09 02:15:27 UTC

  To increase your GitHub API rate limit
  - Use `usethis::create_github_token()` to create a Personal Access Token.
  - Use `usethis::edit_r_environ()` and add the token as `GITHUB_PAT`.

解决方法：
创建个人访问令牌（PAT）
R平台运行

usethis::create_github_token()

将令牌添加到 R 环境：

​​​​​​​usethis::edit_r_environ()

在打开的文件中，添加以下行，并将 YOUR_PERSONAL_ACCESS_TOKEN 替换为在第 1 步中生成的令牌：

GITHUB_PAT=YOUR_PERSONAL_ACCESS_TOKEN

保存并关闭该文件。

重新启动 R 或 RStudio
再次运行 devtools::install_github("explodecomputer/plinkbinr") 来安装

安装gwasvcf

remotes::install_github("mrcieu/gwasvcf", force = TRUE)

安装MVMR

install.packages("MVMR", repos = c("https://mrcieu.r-universe.dev", "https://cloud.r-project.org"))

安装gwasglue

devtools::install_github("mrcieu/gwasglue")