安装R包的几种方法（汇总）

以下载ggplot包为例

        1. 在R studio界面中直接输入函数：

install.packages("ggplot") #直接输入R包的名字即可。

        2. 找不到无法下载的包，可以上Github官网搜索，上面会提供下载方法：

        3. 将包下载到本地后，进行安装：

           3.1 通过浏览器(https://cran.r-project.org/web/packages/ggplot2/index.html)下载R包数据，导入到R studio中（要记住下载包的位置）：

install.packages("ggplot", repos = NULL)

           3.2 通过命令行下载：

download.file("https://cran.r-project.org/src/contrib/ggplot2_3.3.5.tar.gz","ggplot2_3.3.5.tar.gz")

如果是linux界面，可以用choose.files()来手动选择下载位置。

        4. 直接找到包的下载地址：

ggpack<-"https://cran.r-project.org/src/contrib/ggplot2_3.3.5.tar.gz"

install.packages(ggpack, repos=NULL, type="source")

        5.（引用）对于bioconductor的包，执行操作为：

source("http://bioconductor.org/biocLite.R") ##安装BiocInstaller

options(BioC_mirror=”http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/“) 如果需要切换镜像
biocLite("ggbio")

或者直接BiocInstaller::biocLite('ggbio') ## 前提是你已经安装好了BiocInstaller

某些时候你还需要卸载remove.packages("BiocInstaller") 然后安装新的

如果是3.5和以上的版本，需要使用BiocManager

install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("KEGG.db",ask=F,update=F)

备注：起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = ‘libcurl’)就轻轻松松解决啦

        6. （引）如果是linux版本：

sudo su - -c
"R -e "install.packages('ggplot2', repos='https://cran.rstudio.com/')""

        7. （引）进入https://anaconda.org/ ，搜索R包，最下面有下载命令。

 

conda的下载及安装操作见：conda 安装R语言及其R包 - 简书