R语言 最新TwoSampleMR、MRInstruments包安装教程

已于 2022-07-06 16:58:07 修改
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文章标签： r语言 大数据
于 2022-07-04 10:12:53 首次发布
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版权 
##TwoSampleMR包
install.packages("remotes")
remotes::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")


##MRInstruments包
remotes::install_github("MRCIEU/MRInstruments")

GPY Kato
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孟德尔随机化(，MR)是一种利用基因变异作为工具变量来评估暴露与结果之间因果关系的统计方法。它基于这样的原理：基因变异是在出生前就随机分配给个体的，类似于在随机对照试验中随机分配治疗，因此可以帮助区分因果关系和简单相关性。孟德尔随机化通常用于观察性数据，以确定一个特定的生物标志物、行为或其他暴露是否真正地影响了健康结果，而不是仅仅与之相关。通过这种方法，研究者可以减少混杂因素的影响，避免了传统观察性研究中常见的一些偏差。两步法的双样本孟德尔随机化怎么做？2暴露因素+4风险因素+3结果。
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使用GWAS摘要数据进行孟德尔随机化 使用GWAS摘要数据执行孟德尔随机化的软件包。 它使用自动获取数据，并使用多种方法进行分析。 您可以使用尝试使用此程序包中的有限功能，但是对于任何严肃的工作，我们强烈建议您使用此R程序包。 完整文档可在此处获取： ： 2020年1月的重大更新 我们对软件包，数据库和参考面板进行了重大更改。 有关更改的完整详细信息，请访问 安装 要安装TwoSampleMR的最新版本，请照常执行： install.packages("devtools") devtools::install_github("MRCIEU/TwoSampleMR") 要更新软件包，只需再次运行install_github("MRCIEU/TwoSampleMR")命令。 我们建议向前使用此新版本，但在有限的时间内，我们将启用向后兼容性，以防您处于分析中间或需要重现旧的分析。 为了
孟德尔随机化R包：TwoSampleMR和MR-PRESSO安装
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【R包安装】TwoSampleMR 两样本孟德尔随机化
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记录一下TwoSampleMR安装
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虽然有些问题仍然没有解决，但是如果以后再遇到这种github包安装的时候可以借鉴相同思路。为什么要记录TwoSampleMR的安装过程呢？因为这个包足足安装了1个半小时。有帖子说可以用httr包修改代理，但我实在不懂代理是个啥，所有就放弃这个方法了。还是有一些没有解决的问题，比如。安装完依赖包后最后成功。
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