随着NGS技术的进步,许多疾病中人体组织的转录谱分析变得越来越常规,在公共存储库中已存储了PB级的数据。目前需要计算专业知识有限的实验室科学家能够访问和挖掘这些数据,以了解疾病病理学、识别疾病的可靠生物标志物和干预措施的效果(体内或体外)。为此,来自美国研究团队在《Computational and structural biotechnology journal》上发布了一个用于表达数据的开源和可视化分析平台:OmicsView。
OmicsView是什么?
OmicsView是一个开源解决方案,其设计与数据类型无关,所有可视化模块均可轻松适应新的数据类型,并具有简单的用户数据上传过程。此外,研究团队提供了来自与Qiagen合作的10个疾病领域的样本水平基因表达数据集。有了OmicsView,每个实验科学家,无论他们的计算技能水平如何,都可以进行深入的数据分析和解释。
OmicsView的主要分析功能示意图
用户可以在OmicsView:
> 轻松搜索基因(使用基因名、描述、别名或数据库ID)和