EmAtlas是一个综合图谱，收集了哺乳动物发育的多组学数据，涵盖基因表达、染色质可达性等多个层面。它提供了分析工具，用于探索胚胎发育的组织、细胞、基因组、基因和蛋白质水平，帮助揭示胚胎发育的时空动态。EmRanger工具允许用户输入基因列表，进行分析和注释，发现潜在的发育调节因子。EmAtlas在神经元发育研究中展示了其潜力，例如在小鼠和人类胎儿大脑的比较中，发现共同的高变异基因，为研究神经发育疾病提供了线索。
胚胎发育研究的重要性日益显现，这迅速增加了与多组学数据相关专业资源的数量。然而，缺乏全球胚胎发育库和系统分析工具，限制了干细胞研究、人类先天性疾病和辅助生殖领域的发展。2022年10月，《Nucleic Acids Research》发表了一种名为EmAtlas的数据库，收集了最全面的多组学数据，并提供了多尺度工具来探索哺乳动物胚胎发生过程中的时空动态。
EmAtlas是什么？
EmAtlas收集了最全面的哺乳动物发育多组学数据，致力于探索胚胎发生的时空动态，可用于发现新的潜在组织生物标志物，分析细胞异质性，浏览时空表观遗传图谱和生物学通路，探索先驱性蛋白因子的功能域和结构。
EmAtlas的框架
EmAtlas包含了多种类型的基因表达、染色质可达性、DNA甲基化、核小体占位、组蛋白修饰和转录因子的数据，显示了小鼠和人类在几个时间点的完整时空景观，涉及配子发生、植入前，甚至胎儿和新生儿，每个组织都涉及各种细胞类型。为了表征哺乳动物胚胎发生过程中涉及组织、细胞、基因组、基因和蛋白质水平的特征，还开发了这五种尺度的
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