Nextflow生物信息流程（二）：从入门到放弃

什么鬼？把简单的事情弄复杂，连多年的生信老司机都给整不会了。还社区驱动？无力吐槽。没入门，已放弃，白白浪费几十分钟。

既然其官网说了， Linux 是数据科学的通用语言 。为何 Nextflow 搭建的流程没有多少 Linux 的影子？

把简单的生信流程，弄成一个堪比 IT 的大工程？

槽点一：过度包装，徒增复杂性

我们就以其官网提供的核心流程 RNA-seq 为例，来看看这东西到底有多复杂。下面是流程目录。

rnaseq/
├── assets
├── bin
├── CHANGELOG.md
├── CITATIONS.md
├── CODE_OF_CONDUCT.md
├── conf
├── docs
├── lib
├── LICENSE
├── main.nf
├── modules
├── modules.json
├── nextflow.config
├── nextflow_schema.json
├── pyproject.toml
├── README.md
├── subworkflows
├── tower.yml
└── workflows

内容很多，其中：

workflows/
└── r