amber使用MMPBSA.py.MPI报错问题解决

 问题的原因出在mpi4py无法导入
 

接着我试着安装mpi4py:

 （一开始我以为会安装在/home/hfwu/soft/amber22/miniconda/pkgs中）

然后修改/home/hfwu/soft/amber22/bin里面的MMPBSA.py.MPI的抬头信息

#!/home/hfwu/soft/amber22_src/build/CMakeFiles/miniconda/install/bin/python

 

 这里有几个要注意的地方，一开始我使用的miniconda是服务器里的，也就是：

source /data/applications/miniconda3/bin/activate

我想到amber22安装的时候也有下载miniconda，所以我在.bashrc中修改：

source /home/hfwu/soft/amber22/miniconda/bin/activate

后来试了，好像并不影响 。