GBIF的分类单位名称处理工具taxon-name-processing

最新推荐文章于 2024-02-27 13:53:48 发布
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分类专栏： 全球生物多样性（GBIF） GIS相关 文章标签： 工具
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       GBIF的分类单位名称处理工具taxon-name-processing

 

       taxon-name-processing提供了包含名称查询、解析、识别等功能。

 

 

 

参考：

1.tGBIF的分类单位名称处理工具axon-name-processing主页：http://code.google.com/p/taxon-name-processing/

 

 

wsh6759
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name-parser-cli:GBIF 科学名称解析器库的 Java 命令行界面
06-28
GBIF 科学名称解析器库的 Java 命令行界面 #NameParser 实现创建了一个名为 Impl 的包，其中将有一个类将使用 nameparser 库并将从传递的参数创建所需的 json 输出。 #Developers 安装 jdk 1.7.0 安装 Maven ...
vertnet-gbif-diagnostic:帮助在 GBIF 中管理 Vertnet 数据的诊断工具
06-24
《vertnet-gbif-diagnostic：GBIF与VertNet数据诊断工具详解》 在数字化信息时代，生物多样性数据的管理和分析变得尤为重要。Verne t-GBIF-Diagnostic是一个针对生物多样性研究领域的专业工具，它专注于帮助用户在...
PBDB Data Service：Specifying taxonomic names（指定分类名称）
whitedrogen的博客
05-08 1844
关于缩写，要记住的最重要的事情是，如果您的缩写与多个分类单元匹配，则所选的分类单元将是数据库中出现次数最多的分类单元。选择器应该是包含您感兴趣的分类单元的任何分类单元的前几个字母（3 个或更多）。它描述了用于在查询操作中指定分类名称的参数，以及可应用于分类名称以精确指定生命树的一部分的修饰符。排除项必须与其修改的名称的子分类单元匹配。例如，以下查询将显示。参数，则会返回该分类单元标识的实例列表，包括任何子分类群。如果使用的同音异义词名称未指定任何选择器，则默认情况下将选择数据库中出现次数最多的同音异义词。
R语言【rgbif】——occ_download()，occ_download_prep()：启动GBIF数据的下载请求。
最新发布
whitedrogen的博客
02-27 871
使用 occ_search() 只能获取十万条数据，如果妄想通过 start 和 limit 突破，则会返回： <simpleError: Max offset of 100001 exceeded Usage Arguments 参数【...】：对于occ_download() 和 occ_download_prep()，一个或多个 occ_predicate 或occ_predicate_list 类的对象，由 pred* 函数创建。如果使用了此参数，则无法使用参数【body】。参数【
用R分析微生物组群落数据（1） 软件安装、数据集下载和导入
LonghaoJia的博客
08-06 9153
参考： https://grunwaldlab.github.io/analysis_of_microbiome_community_data_in_r/index.html 1.下载需要的软件和数据 1.1 安装R、Rstudio和必要的R包 1.1.1 安装R R是一门关注统计学、数据科学、可视化的编程语言。它可以再所有的公共操作系统安装，R语言可以从如下地址下载： https://cra...
GBIF查询gbif-wdpa介绍
wsh6759的CGIS专栏
04-01 1025
GBIF查询gbif-wdpa介绍       gbif-wdpa提供了一种基于世界保护区生物数据的工具，支持交叉查询。   参考： 1.GBIF查询gbif-wdpa主页：http://code.google.com/p/gbif-wdpa/
GBIF自由文本识别学名taxon-finder介绍
wsh6759的CGIS专栏
04-02 887
GBIF自由文本识别学名taxon-finder介绍                                                taxon-finder提供从自由文本中识别生物学名。     参考资料 1.     GBIF自由文本识别学名taxon-finder主页： http://code.google.com/p/taxon-finder/
GBIF索引工具gbif-indexingtoolkit
wsh6759的CGIS专栏
04-01 573
GBIF索引工具gbif-indexingtoolkit           这GBIF HIT是一种使用简单对外开放源框架,允许你容易很快地建立和管理数据，并可以采集具体指标数据。根据说明就可以建立相关工具与服务，有需要的赶快下载试用吧~~     参考： 1.GBIF索引工具gbif-indexingtoolkit主页： http://code.google.com/p/gbi
GBIF数据转换工具gbif-dtt介绍
wsh6759的CGIS专栏
04-02 1319
GBIF数据转换工具gbif-dtt介绍                                                 gbif-dtt提供数据转换工具。     参考资料 1.     BGIF数据转换工具gbif-dtt主页：  http://code.google.com/p/gbif-dtt/
R统计绘图-rgbif包下载GBIF数据及绘制分布图
qq_39859424的博客
08-30 3555
1基本信息 博士退学前，做完斑马鱼的Phylogenomics分析，系统进化树冲突、基因流、ILS和种群历史动态等分析了之后，需要看一下Danio属物种的地理分布，希望能跟Phylogenomics分析结果有所印证。所以，自己在网上搜索生物分布数据库，找到了很多有物种分布数据的数据库(可惜当时没有好好整理成文档)，要不就是不全，要不就是不容易整理(还是编程能力不强)。最后发现了GBIF(Global Biodiversity Information Facility，https://www.gbif...
Python库 | taxon_names_resolver-1.0.3.tar.gz
03-11
总之，taxon_names_resolver是Python生态系统中一个实用的生物分类学工具，它简化了生物名称的管理和处理，使得非生物信息学背景的开发者也能轻松地进行相关的数据分析工作。通过理解和利用这个库，我们可以更好地...
gbif-api:gbif API
07-14
至于压缩包子文件的文件名称列表"gbif-api-master"，这很可能是项目源代码的主分支名称，"master"通常是Git版本控制系统中的默认分支，代表了项目的主线代码。这表明下载的压缩包包含了完整的GBIF API项目源码，包括...
GBIF dataset metrics-crx插件
04-03
这些指标以堆叠的条形图可视化-显示记录的分布，坐标，多媒体和与GBIF主干匹配的分类单元-交互式分类分区，图像样本（如果有）和下载图表。 得分特别高的指标突出显示为成就。 这些功能不仅可以通知用户数据集包含...
GBIF数据门户介绍gbif-dataportal
wsh6759的CGIS专栏
04-01 2352
GBIF数据门户介绍gbif-dataportal             GBIF门户的数据服务,通过其网络提供数以百万计的科学数据， 这些数据是由来自世界各地机构和组织提供并可作为科学研究使用。其使用geoserver发布数据，也是充分利用了GIS软件的优越性，有兴趣可以关注。   参考： 1.GBIF数据门户主页 http://code.google.com/p/gbif-dat
GBIF 资源介绍 IPT等
wsh6759的CGIS专栏
04-01 1904
GBIF 资源介绍         GBIF是Global Biodiversity Information Facility（全球生物多样性信息机构）的缩写，其工作目标就是为每个互联网用户免费开放地提供数字化生物多样性数据。GBIF 可以为决策人员、科研人员和一般用户提供科学的生物多样性数据。GBIF 同时对开源软件和开放数据访问提供资助。         GBIF 同时也是一个数据提
GBIF数据注册gbif-registry介绍
wsh6759的CGIS专栏
04-01 1812
GBIF数据注册gbif-registry介绍        GBIF数据注册gbif-registry是基于java开发，并在Structs 2开发框架下完成的。        参考： 1.GBIF数据注册gbif-registry主页：http://code.google.com/p/gbif-registry/ 2.gbif-registry的报告:http://code.g
GBIF IPT资源介绍
wsh6759的CGIS专栏
04-01 1037
GBIF IPT资源介绍          GBIF IPT是一个基于Java的网络应用程序。它可以嵌入到自己的数据库中，并可以很容易地定制和实现多语设置。它是一个基于角色的用户管理特征，可以允许多个数据管理者来共享数据。       它可以连接和提供三种生物多样性数据的服务：保本数据、物种名录和一般资源元数据。IPT管理多个数据源，并且有多种上传选择：关系型数据库管理系统或表格。但是，它不
GBIF种群分布库gbif-sdr介绍
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04-01 955
GBIF种群分布库gbif-sdr介绍           gbif-sdr提供了GBIF种群分布资料。   参考： 1.GBIF种群分布库gbif-sdr主页：http://code.google.com/p/gbif-sdr/
python GBIF
10-10
GBIF 是国际生物多样性信息设施（Global Biodiversity Facility）的缩写，是一个全球性的、开放获取的生物多样性数据平台。GBIF 提供了大量的生物多样性数据，包括物种分布、描述、分类等信息，这些数据可以通过 API 进行访问和使用。 在 Python 中，你可以使用 GBIF 提供的 API 来获取和利用这些数据。下面是一个简单的示例代码，展示了如何使用 Python 请求库和 GBIF 的 API 来搜索物种信息： ```python import requests def search_species(species_name): url = f"https://api.gbif.org/v1/species/search?q={species_name}" response = requests.get(url) data = response.json() # 处理返回的数据 # 这里只是简单地打印物种名称和分类信息 for result in data['results']: print(f"物种名称: {result['species']}") print(f"分类信息: {result['kingdom']}, {result['phylum']}, {result['class']}, {result['order']}, {result['family']}, {result['genus']}") print() ``` 使用该函数可以搜索给定物种名称的相关信息，并将其打印出来。你可以根据自己的需求进行进一步处理和利用。
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