【学习总结】人群队列数据分析【总结】

最新推荐文章于 2024-07-02 01:20:15 发布
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分类专栏： 数据分析
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本文是关于人群队列数据分析的学习总结，涵盖了基础遗传学/统计学知识，关联分析，全基因组关联分析，Meta分析，以及表型预测和基因间交互效应。重点介绍了使用R语言进行数据分析和解释，包括哈迪温伯格定律的验证，GWAS的实施和解释，以及Meta分析和表型预测模型的构建。
摘要由CSDN通过智能技术生成

上周学习了刘老师人群队列数据实战的课程，自己受益匪浅，课程主要讲的是大人群队列数据分析的一些背景知识和底层原理，并且使用R语言进行代码实现。
本篇笔记主要是对人群队列数据分析的基础知识和流程进行一个大体的总结回顾，具体的每个单独模块的细节内容和代码，我也都做了笔记，并且整理好了放在个人的Github上，目录如下

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【数据结构】—— 队列基础知识以及数组模拟队列的分析、演示及优化
周小末天天开心的博客
11-10 1805
队列基础知识——数组模拟队列和数组模拟环形队列的分析和演示
【学习总结】人群队列数据分析
Yujia's Blog
06-24 3191
上周学习了刘老师人群队列数据实战的课程，自己受益匪浅，课程主要讲的是大人群队列数据分析的一些背景知识和底层原理，并且使用R语言进行代码实现。 本篇笔记主要是对人群队列数据分析的基础知识和流程进行一个大体的总结回顾，具体的每个单独模块的细节内容和代码，我也都做了笔记，并且整理好了放在个人的Github上，目录如下 【学习笔记整理目录】 1-基础遗传学/统计学知识复习 2-关联分析 3-M...
（超详细）数据结构——“队列”的深度解析
最新发布
qq_58761784的博客
07-02 2274
队列与栈都是线性表，它们的结构也非常类似，都是一头进一头出，那么它们有什么区别吗？答案是有的，虽然它们同为线性表，但是栈的出栈入栈方式为后进先出，而队列的出栈入栈方式为先进先出，具体我们在正文讲解。
队列数据结构详解
slgcsdn的博客
03-30 2360
1.队列既可以用链表实现，也可以用顺序表实现。跟栈相反的是，栈一般用顺序表来实现，而队列我们常用链表来实现，称为链队列，它是后入前出(头结点进，尾结点出)，头结点不存元素 实现代码： typedef struct QNode//定义队列的链表结点 { ElemType data; struct QNode *next; }QNode,*QueuePrt; typedef struct { QueuePrt front,rear;//队头，尾指针 }LinkQueue; 代码思路：队列数据结构的定义和
【医学信息学】研究和统计——队列研究和数据分析
村口小张的的博客
08-07 6448
什么是队列研究 队列研究是一种临床研究方法，属于观察性研究。 定义: 特定的人群按照暴露、未暴露于某种因素分为两组，然后追踪一定的时间，比较两组发病或死亡的结局，从而研究暴露因素与结局的关联。 目的：检验病因假设、评价预防的效果、研究疾病的自然史 分类：固定队列、动态队列 类型：前瞻性队列研究（所研究的疾病发病率或者死亡率一般不低于千分之5）、回顾性队列研究、双向队列研究 队列研究的关键指标 危险因素 主要危险因素 可能危险因素 研究结局 发病、死亡、分子标志（...
近10万人基因组数据！美国All of Us项目发布首批人群队列数据
悟道西方
04-04 473
近日，美国“All of Us”研究项目公布了第一批近10万人的全基因组测序数据，同时包括身高、体重和血压等身体相关数据，以及调查数据，例如关于参与者的人口统计数据、生活方式和总体健康状况的数据。这些基因组数据可以通过一个基于云的平台All of Us研究员工作台获得。随着All of Us首批基因数据的发布，将有助于研究人员解决健康和疾病相关尚未回答的问题，进而推动新的...
数据分析学习总结笔记13：生存分析及Python实现
weixin_41961559的博客
04-18 7769
文章目录1 引言2 定义3 数学直观4 Kaplan-Meier 估计5 Cox比例风险模型6 总结 1 引言 生存分析是一套统计方法，用来解决诸如“多长时间后，某个特定事件发生”这样的问题; 换句话说，也可以称之为**“事件时间分析”**。 这种方法被称为生存分析，是由于主要是由医学研究人员开发的，他们更感兴趣的是寻找不同群体患者的预期寿命(例如: 用药物a治疗的组群1和用药物b治疗的组群2)。...
"乳腺癌表观遗传数据模式识别的荟萃分析和机器学习方法
医学信息学解锁24（2021）100629整合荟萃分析和监督机器学习用于使用表观遗传数据的乳腺癌模式识别Reza Panahia，*，Esmaeil Ebrahimiea，b，c，Ali Niazi a，Alireza Afsharifar da伊朗设拉子设拉子大学生物技术...
数据结构之线性表，这一篇就够了，吐血总结，建议收藏~~
热门推荐
weixin_46002185的博客
01-09 1万+
线性表及其顺序存储结构 痛定思痛，决定吐血总结一下线性表相关的知识，篇幅较多，字数较长，建议收藏学习！ 另外，请大家多多指教！ 又到了幼儿园放学的时间，今天天气很不错，光明顶幼儿园门口很多家长来接自己家的小宝贝，只见老师带着小朋友们，一个拉着另一个的衣服，依次从教室出来。而且我发现很有规律的是，每次他们的次序都是一样。比如宋远桥的儿子排在第5个，据说每次他都是在第5个，前面同样是那个小女孩，后面一直是那个小男孩。这点让我很奇怪，为什么一定要这样？ 后来从老师那里得知，为了保障小朋友的安全，避免漏掉小朋友，所
数据结构之链表栈与队列
08-26
为了进一步学习和实践这些概念，我们可以分析提供的压缩包文件"Link"，它可能包含了关于链表、栈和队列的代码实现或示例。通过阅读和理解这些代码，你可以加深对这些数据结构的理解，并提升编程技能。 总结来说，...
基于队列的分析研究
zhouyunjian的博客
06-02 1164
本文主要介绍基于队列的分析研究，内容分为以下几大块： 队列的性质以及特点 队列的分类、使用方法、代码实战 高并发队列分析与压测报告 队列与设计模式的关联 交易系统的应用场景分析 bat面试中队列常见题 队列的性质以及特点 Queue： 基本上，一个队列就是一个先入先出（FIFO）...
【数据结构】—— 队列基础知识以及数组模拟队列的分析、演示及优化_arr 队列
2401_84182578的博客
04-17 1007
例如当 rear = 2 ，front = 0 时，maxSize - 1 = 2，maxSize = 3（因为下标从零开始），所以(2 + 1) % 3 == 0，所以队列已满。再次存入数据发现就算是取出了数据的情况下依然不能向队列中存入数据，没有达到复用的效果，所以我们可以优化一下我们的程序，让它在取出数据后依然可以继续存入。例如当 rear = 2，front =0，maxSize = 3时，(2 + 3 - 0) % 3 等于 2 ，说明该队列中有效数据的个数为两个。可以看到运算全部正确。
中国人群队列的TNBC转录组和基因组图谱
leianuo123的博客
08-08 1706
这篇文章是2019年上海交通大学邵志敏教授团队蒋一舟博士的文章 本文基于中国人群465个TNBC样本进行RNA-seq和外显子测序，并结合拷贝数变异，来分析中国人群的TNBC的特点，根据分子图谱，作者将中国人群的TNBC分为4个亚群。 本文聚焦 1.中国人的TNBC更倾向于PIK3CA的突变，而且表现的更像LAR亚型相比于TCGA基于欧洲人的基因组学图谱。 2.基于转录组的特点，将中国人的TNBC分为4个亚型。 3.多组学测绘鉴定出了TNBC亚型的潜在靶点。 根据临床特征和基因组和转录组学数据，将465例
R语言入门与实战：大数据人才缺口巨大，现在学习还不晚
lihuixin_的博客
06-20 360
数据时代已经到来，但数据分析、数据挖掘人才却十分短缺，据全球顶尖管理咨询公司麦肯锡(McKinsey)一份详细分析报告显示：预计到2018年，大数据或者数据工作者的岗位需求将激增，其中大数据科学家的缺口在14万到19万之间，对于懂得如何利用大数据做决策的分析师和经理的岗位缺口则将达到150万！ 先来了解一下数据分析，就是以商业目的为驱动，所开展的获取数据、处理数据、分析数据、展示数据和撰写数...
R 语言 多项式分布的极大似然估计
Mrrunsen的博客
10-07 622
这里介绍一个数量遗传学中的多项式分布，哈迪-温伯格平衡（hardy-weinberg equilibrium）。该定律是说在一个大且随机交配的种群中，基因频率和基因型频率在没有迁移、突变和选择的条件下会保持不变。可以看到Mourant数据集有5列，前2列是群体信息，后4列是基因型频率。这里以第216个群体为例，计算等位基因M频率p的极大似然估计。下面用代码说明，这里用到了HardyWeinberg包中的Mourant数据集，该数据集包含216个群体MN血型系统的基因型频率。
R语言各种假设检验实例整理（常用）
weixin_33968104的博客
04-17 6698
版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 一、正态分布参数检验 例1. 某种原件的寿命X（以小时计）服从正态分布N（μ, σ)其中μ, σ2均未知。现测得16只元件的寿命如下： 159 280 101 212 224 379 179 264 222 362 168 250 149 260 485 170 ...
你需要了解的群体重测序都在这里（一）
SHANGHAILINGEN的博客
04-19 1955
群体重测序的分析包括的基本统计量介绍
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