【学习总结】人群队列数据分析【总结】

最新推荐文章于 2024-07-02 01:20:15 发布
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分类专栏： 数据分析
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本文是关于人群队列数据分析的学习总结，涵盖了基础遗传学/统计学知识，关联分析，全基因组关联分析，Meta分析，以及表型预测和基因间交互效应。重点介绍了使用R语言进行数据分析和解释，包括哈迪温伯格定律的验证，GWAS的实施和解释，以及Meta分析和表型预测模型的构建。
摘要由CSDN通过智能技术生成

上周学习了刘老师人群队列数据实战的课程，自己受益匪浅，课程主要讲的是大人群队列数据分析的一些背景知识和底层原理，并且使用R语言进行代码实现。
本篇笔记主要是对人群队列数据分析的基础知识和流程进行一个大体的总结回顾，具体的每个单独模块的细节内容和代码，我也都做了笔记，并且整理好了放在个人的Github上，目录如下

【学习笔记整理目录】
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wx1871428
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R 语言 多项式分布的极大似然估计
Mrrunsen的博客
10-07 621
这里介绍一个数量遗传学中的多项式分布，哈迪-温伯格平衡（hardy-weinberg equilibrium）。该定律是说在一个大且随机交配的种群中，基因频率和基因型频率在没有迁移、突变和选择的条件下会保持不变。可以看到Mourant数据集有5列，前2列是群体信息，后4列是基因型频率。这里以第216个群体为例，计算等位基因M频率p的极大似然估计。下面用代码说明，这里用到了HardyWeinberg包中的Mourant数据集，该数据集包含216个群体MN血型系统的基因型频率。
数据结构之链表栈与队列
08-26
为了进一步学习和实践这些概念，我们可以分析提供的压缩包文件"Link"，它可能包含了关于链表、栈和队列的代码实现或示例。通过阅读和理解这些代码，你可以加深对这些数据结构的理解，并提升编程技能。 总结来说，...
【学习总结】人群队列数据分析
Yujia's Blog
06-24 3187
上周学习了刘老师人群队列数据实战的课程，自己受益匪浅，课程主要讲的是大人群队列数据分析的一些背景知识和底层原理，并且使用R语言进行代码实现。 本篇笔记主要是对人群队列数据分析的基础知识和流程进行一个大体的总结回顾，具体的每个单独模块的细节内容和代码，我也都做了笔记，并且整理好了放在个人的Github上，目录如下 【学习笔记整理目录】 1-基础遗传学/统计学知识复习 2-关联分析 3-M...
（超详细）数据结构——“队列”的深度解析
最新发布
qq_58761784的博客
07-02 2248
队列与栈都是线性表，它们的结构也非常类似，都是一头进一头出，那么它们有什么区别吗？答案是有的，虽然它们同为线性表，但是栈的出栈入栈方式为后进先出，而队列的出栈入栈方式为先进先出，具体我们在正文讲解。
R语言各种假设检验实例整理（常用）
weixin_33968104的博客
04-17 6696
版权声明：本文为博主原创文章，转载请注明出处 一、正态分布参数检验 例1. 某种原件的寿命X（以小时计）服从正态分布N（μ, σ)其中μ, σ2均未知。现测得16只元件的寿命如下： 159 280 101 212 224 379 179 264 222 362 168 250 149 260 485 170 ...
【数据结构】—— 队列基础知识以及数组模拟队列的分析、演示及优化
周小末天天开心的博客
11-10 1803
队列基础知识——数组模拟队列和数组模拟环形队列的分析和演示
你需要了解的群体重测序都在这里（一）
SHANGHAILINGEN的博客
04-19 1922
群体重测序的分析包括的基本统计量介绍
数据采集的方法有哪些.docx
03-09
根据不同的来源和方法，可以将数据采集分为多种类型，本文将对常见的数据采集方法进行总结和介绍。 一、CS 软件数据采集技术 CS 软件数据采集技术是指从 C/S 架构软件中采集数据的方法，这类软件属于比较老的架构...
数据分析基础篇---统计学基础
weixin_42248408的博客
08-14 1417
描述数据 频数分布表、树图、 频数密度=频数/组距 算数平均值、中位数、众数 四分位数间距法（剔除异常值）/百分位数 数据排序 中位数分成项数相等的高低两组 低值组中位数，第一四分位数Q1 高值组中位数，第三四分位数Q3 四分位间距 IQR=Q3-Q1 展示方式：矩形-胡须图（也叫箱线图） 标准离差 方差 标准差 z-比值/标准比值 ：从数据点到平均值的标准离差个数 经验法则：对于接近正态分布的数...
R语言入门与实战：大数据人才缺口巨大，现在学习还不晚
lihuixin_的博客
06-20 359
数据时代已经到来，但数据分析、数据挖掘人才却十分短缺，据全球顶尖管理咨询公司麦肯锡(McKinsey)一份详细分析报告显示：预计到2018年，大数据或者数据工作者的岗位需求将激增，其中大数据科学家的缺口在14万到19万之间，对于懂得如何利用大数据做决策的分析师和经理的岗位缺口则将达到150万！ 先来了解一下数据分析，就是以商业目的为驱动，所开展的获取数据、处理数据、分析数据、展示数据和撰写数...
结合机器学习的人口模型能够提高心理健康测量的准确性
ashu216的博客
12-17 735
这篇研究去年发表在GigaScience [IF:7.658]，研究基于MRI数据和社会人口学变量使用机器学习方法构建群体模型从而预测个体的心理健康测量。我在这里做个笔记，顺便分享。这里只介绍方法，主要结果和结论。
05、消息队列中数据丢失了怎么办
一诺
12-22 5732
1、面试题 如何保证消息的可靠性传输（如何处理消息丢失的问题）？ 2、面试官心里分析 这个是肯定的，用mq有个基本原则，就是数据不能多一条，也不能少一条，不能多，就是刚才说的重复消费和幂等性问题。不能少，就是说这数据别搞丢了。那这个问题你必须得考虑一下。 如果说你这个是用mq来传递非常核心的消息，比如说计费，扣费的一些消息，因为我以前设计和研发过一个公司非常核心的广告平台，计费系统，计费系...
【数据结构】—— 队列基础知识以及数组模拟队列的分析、演示及优化_arr 队列
2401_84182578的博客
04-17 1003
例如当 rear = 2 ，front = 0 时，maxSize - 1 = 2，maxSize = 3（因为下标从零开始），所以(2 + 1) % 3 == 0，所以队列已满。再次存入数据发现就算是取出了数据的情况下依然不能向队列中存入数据，没有达到复用的效果，所以我们可以优化一下我们的程序，让它在取出数据后依然可以继续存入。例如当 rear = 2，front =0，maxSize = 3时，(2 + 3 - 0) % 3 等于 2 ，说明该队列中有效数据的个数为两个。可以看到运算全部正确。
中国人群队列的TNBC转录组和基因组图谱
leianuo123的博客
08-08 1703
这篇文章是2019年上海交通大学邵志敏教授团队蒋一舟博士的文章 本文基于中国人群465个TNBC样本进行RNA-seq和外显子测序，并结合拷贝数变异，来分析中国人群的TNBC的特点，根据分子图谱，作者将中国人群的TNBC分为4个亚群。 本文聚焦 1.中国人的TNBC更倾向于PIK3CA的突变，而且表现的更像LAR亚型相比于TCGA基于欧洲人的基因组学图谱。 2.基于转录组的特点，将中国人的TNBC分为4个亚型。 3.多组学测绘鉴定出了TNBC亚型的潜在靶点。 根据临床特征和基因组和转录组学数据，将465例
list筛选数据_ROC居然能够批量筛选
weixin_36320737的博客
12-25 757
生信分析第四步：ROC曲线下面积批量筛选方法各位解螺旋的小伙伴的大家好，欢迎来到每周一次的先锋宇专栏，不知道大家对于我每周日的专栏有没有一些期待呢？上一次的批量绘制生存曲线在各位小伙伴中反应很大，很多小伙伴都说再也不用在线数据库绘制生存曲线，感觉真的是奇丑无比。收到这样的反馈看来先锋宇助教把大家的审美水平提高了不止一点点，那么今天我们继续往下走，我们来看看根据ROC曲线下的面积来进行批量...
队列数据结构详解
slgcsdn的博客
03-30 2355
1.队列既可以用链表实现，也可以用顺序表实现。跟栈相反的是，栈一般用顺序表来实现，而队列我们常用链表来实现，称为链队列，它是后入前出(头结点进，尾结点出)，头结点不存元素 实现代码： typedef struct QNode//定义队列的链表结点 { ElemType data; struct QNode *next; }QNode,*QueuePrt; typedef struct { QueuePrt front,rear;//队头，尾指针 }LinkQueue; 代码思路：队列数据结构的定义和
【数据结构】栈和队列详细分析（全）
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码农研究僧的博客
05-05 1万+
前言 栈和队列是两种重要的线性结构。从数据结构角度看，栈和队列也是线性表， 其特殊性在于栈和队列的基本操作是线性表操作的子集，它们是操作受限的线性表，因此，可称为限定性的数据结构。 栈的定义与特点 栈是限定仅在表尾进行插入或删除操作的线性表。 表尾称为栈顶,表头端称为栈底 。不含元素的空表称为空栈。栈的修改是按后进先出的原则进行的。 栈的操作 队列的定义与特点 和栈相反，队列是一种先进先出的线性表。它只允许在表的一端进行插入，而在另一端删除元素，允许插入的一端称为队尾，允许删除的一端则称为队头。 ...
数据结构之队列——Queue详细分析
mzk的博客
10-16 1087
概念： Queue： 基本上，一个队列就是一个先入先出（FIFO）的数据结构 Queue接口与List、Set同一级别，都是继承了Collection接口。LinkedList实现了Deque接口。 Queue的介绍 没有实现的阻塞接口的LinkedList： 实现了java.util.Queue接口和java.util.AbstractQueue接口 　　内置的不阻塞队列： Priority...
数据结构精华总结：考研&求职必备
《数据结构知识点总结》是针对计算机考研及求职者的一份详细复习资料，涵盖了数据结构的核心概念和算法实现。这份资料由旺旺考研官方整合教材、习题和网络资源精心编排，旨在帮助考生高效复习，节省自行整理的时间。...
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