matlab读、写nii（保持头文件不变）

最新推荐文章于 2024-01-10 12:24:18 发布

<paradox.h>

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文章标签： matlab 开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/xcxcxcxc12321/article/details/131970138

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读、写nii文件示例（不支持nii.gz文件直接读写，需要先gunzip解压）
可以做到保持头文件信息（如spacing，origin等信息）不变

addpath(genpath('.../spm12/'))

% unzip
input_file_name = '/home/data/IXI012-HH-1211-MRA_001.nii.gz';
gunzip(input_file_name)

% path
input_file_name = '/home/data/IXI012-HH-1211-MRA_001.nii';
output_file_name = '/home/data/IXI012-HH-1211-MRA_001_skeleton.nii';

% read nii
img = spm_vol(input_file_name);  % read nii (not support nii.gz)
testvol = spm_read_vols(img);  % get mat data
testvol = logical(testvol);  % logical type for analysis

% process data  (extract skeleton of the vessel segmentation for example)
skel = Skeleton3D(testvol);  % extract skeleton (process mat data)

% save nii with changed filename and data
skel = uint8(skel);  % data format (uint8) for saving nii
img.fname = output_file_name;  %更改输出文件名,否则会覆盖原文件
spm_write_vol(img, skel);  % write image