分子动力学lammps初中级

分子动力学模拟是一种研究分子体系结构与性质的重要方法，已被广泛用于化学化工、生物医药、材料科学与工程、物理等学科领域。传统实验需要大量的人力物力而且耗时，而计算机模拟的方法省时省力，可以用来求解解析理论无法求解的问题，模拟实验做起来困难或不可能做的条件，得到更贴近实际体系的结果。LAMMPS分子动力学程序是一款开源而免费的软件，可以模拟成千上万甚至几百万个原子、分子，常用于模拟液体中的粒子，固体和汽体的系综，也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子，聚合物，生物，金属，粒状和粗料化体系。
课 程
Courses

内 容
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第一天 上午
First day

LAMMPS基础
LAMMPS foundations

1 分子动力学模拟入门理论——掌握LAMMPS的in文件中各命令的意义
Introduction to Molecular Dynamics Simulation Theory —— Understanding the Significance of Commands in LAMMPS in Documents

1.1系综理论
1.1 Integrated theory

1.2主要算法介绍
1.2 Introduction of main algorithms

1.3积分步长的选取
1.3 Selection of integral steps

1.4温度和压力控制
1.4 Temperature and pressure control

1.5周期性边界条件
1.5 Periodic boundary conditions

1.6分子动力学模拟流程
1.6 Molecular dynamics simulation process

下午
Afternoon

LAMMPS入门学习
LAMMPS entry-level learning

2 LAMMPS入门操作基础
2LAMMPS fundamentals

2.1 Linux命令入门基础——掌握运行LAMMPS常用的Linux命令
Linux command entry base —— master Linux commands commonly used to run

2.2 LAMMPS中一些安装包的介绍——为以后创建自己体系进行选择性安装
2.2 Introduction to some installation packages in the LAMMPS —— selective installation for later creation of your own system

2.3 LAMMPS的linux版串行和并行及GPU版编译安装——掌握LAMMPS的编译方法，针对自己体系编译可执行文件。
LAMMPS linux version of serial and parallel and GPU version of the compilation and installation —— master the compilation method for their own system to c