免费AI标注工具-医疗影像标注工具

医疗相关的AI产品对于相关公司和医院目前大多是冰火两重天的场景，一面是近些年积极研发、造势的AI相关公司的高涨热情，一面是医院使用率低、效果不佳的尴尬境遇，但对于医疗影像的AI相关产品的研究绝对不会止步，所以今天我们分享一个医疗影像的标注工具，给相关研究的小伙伴做一个参考。

 

本文主要从两个方面进行说明：

    1.医疗影像数据格式

    2.医疗影像标注工具

 

一.医疗影像数据格式

DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)，文件后缀名.dcm。被广泛应用于放射医疗领域，如：CT、DR、核磁共振、超声等。在影像科、眼科、牙科等都有广泛的应用。

 

DICOM标准中涵盖了医学数字图像的采集、归档、通信、显示及查询等几乎所有信息的交换协议；

 

dcm文件数据结构：

数据集（Data Set）来保存前面所介绍的信息对象定义（IOD），数据集又由多个数据元素（Data Element）组成。每个数据元素描述一条信息（所有的标准数据元素及其对应信息在标准的第六部分列出），它由对应的标记（8位16进制数，如（0008，0016），前4位是组号（Group Number），后4位是元素号（Element Number）确定 DICOM数据元素分为两种：

● 标准（Standard）数据元素，组号为偶数，含义在标准中已定义。

● 私有（Private）数据元素，组号为奇数，其描述信息的内容由用户定义

 

CT影像样例：

DR影像样例：

 

了解DICOM文件的数据结构非常重要，我们在一般处理医疗数据的时候，必须要进行脱敏脱密，而从医院的PACS系统导出来的时候已经包含了一些病人的隐私信息，所以技术上的脱密脱密是必须要经历的环节。这部分内容不做本文重点就不在本文详细介绍。

 

二.医疗影像标注工具

 此影像工具可以标注.dcm格式的片子，如：CT、DR、超声等。

注：文件命名及文件夹名称不能包含中文，否则打不开。

显示界面：

工具栏：

1. 打开数据时， 点击左上角 File → Open Image …

2. 选定 Dicom 数据所在的文件夹， 选择第一张图片

3. 然后点open然后在Imagefileformat下面选择DICOMImageSeries，点击 next。

    4.加载影像后可点击右键放大缩小。

    5.数据标注

    按住鼠标左键拖动，勾勒出病灶位置的轮廓，点击两次回车， 标注覆盖整个区域。

    6.按照上述方法，逐层将数据标注完成后，保存数据结果。

       Segmentation → Save Segmentation Image …

 

以上就是影像标注工具的使用方式，医疗AI落地上遇到了很多问题，同时在医疗数据的采集和标注部分同样的遇到了很多挑战，例如：1.采集部分信息安全的问题，2.标注时需要专业的医生进行标注，当然是越专业越好，例如我之前经历的几个项目，都必须具有5年以上的主治医生进行标注或质检。3.责任、政策、法律的支持等等问题。但医疗资源比较紧缺且不平衡的现实面前也是必须落地的场景，希望小伙伴们可以一起加油。

 

最后还是资源福利，获取方式还是两种：

    1.分享文章到朋友圈3小时以上发到公众号后台。

    2.公众号--互动专区--猿小店直接获取。