neuromaps: structural and functional interpretation of brain maps 多模态、多尺度脑科学数据综合分析的利器

简介

成像技术越来越多地用于生成大脑结构和功能的高分辨率参考图。将实验生成的脑图与这些参考脑图进行比较有助于跨学科的科学发现。尽管最近的数据共享计划增加了脑图的可访问性，但数据通常在不同的坐标系中共享，从而排除了系统和准确的比较。

近日，Bratislav Misic团队在最新一期的Nature Methods杂志上介绍了他们最新的研究成果“neuromaps: structural and functional interpretation of brain maps”。本研究提出了一个神经图，这是一个用于访问、转换和分析大脑结构和功能注释的工具箱。neuromaps将开放存取数据与用于标准化和比较脑图的透明功能相结合，为人脑的全面结构和功能注释丰富分析提供了系统的工作流程。

成像和记录技术用于生成人脑的高分辨率脑图，这些脑图提供了对大脑结构和功能结构的深入了解。此类脑图越来越多地在NeuroVault或BALSA等开放存储库上共享，它们共同提供了中枢神经系统的全面多模式视角。但是，这些数据共享平台仅限于表面或体积数据，且没有集成标准化的分析工作流程。

作者介绍了一个开放访问的Python工具箱，neuromaps，以使研究人员能够系统地共享、转换和比较脑图（图1）。neuromaps软件工具箱在neuromaps上可用，在PyPi、Zenodo上，它作为Docker容器存在，文档可以在GitHub页面上找到（https://netneurolab.github.io/neuromaps）。