awk-3

file

1    115466        S        C        ./.        ./.        0/0        ./.        ./.

r1   546608      F        C        ./.        0/1        0/0        ./.        1/1

r2  566085        T        H        0/0        ./.        0/1        ./.        ./.

要求：

前四个字符不动，从第五个字符开始，统计后面的后面各个字符出现的次数，处理好的结果如下：

1   115466  S  C  0/0:1  ./.:4

r1  546608  F  C  1/1:1  0/0:1  0/1:1  ./.:2

r2  566085  T  H  0/0:1  0/1:1  ./.:3

 

awk '{for(i=5;i<=NF;i++)a[$i]++;for(i=1;i<=4;i++)printf "\t" $i;for(i in a)printf "\t" i":"a[i];printf "\n";delete a }' file |column -t

解释：a[$i]++之后没有END，因为这里是统计的是每行的数字不是总共的数字，这次统计没有完成，统计完成到输出这行才是一次处理结果的结束。最后的delete a的意思是将整个数组删除，原因为如果不删除的话，那么上次统计的结果仍然会存储在数组中。导致结果的不准确。