生信笔记：E值究竟是什么？！！！

先来看E值的计算公式：
$$E=kmn{e}^{-\lambda S}$$
$k,\lambda$ 是两个修正参数，与数据库和算法有关，用来平衡不同打分矩阵和搜索空间对搜索结果的影响（The parameters K and λ represent natural scales for the search space and the scoring system respectively.）
$m$：目标序列长度
$n$：数据库总残基数
$S$：得分

再来看NCBI中对E值的定义：

The Expect value (E) is a parameter that describes the number of hits one can “expect” to see by chance when searching a database of a particular size. It decreases exponentially as the Score (S) of the match increases. Essentially, the E value describes the random background noise. For example, an E value of 1 assigned to a hit can be interpreted as meaning that in a database of the current size one might expect to see 1 match with a similar score simply by chance.

期望值（E）是一个参数，它描述在搜索特定大小的数据库时偶然可以“期望”看到的hit数量。 随着分数（S）的增加，它呈指数下降。 本质上，E值描述了随机背景噪声。 例如，某个hit的E值为1可以解释为：在当前大小的数据库中，在随机的情况下，偶然出现的匹配结果数为1。