量化计算 Gaussian 09

1. 用途

采用Gaussian 09程序进行量子化学计算。已实现的作业类型包括:单点能、几何优化、振动频率、ECD/UV、NMR、比旋光度计算。

2. 入口

平台地址:殷赋云 - 科研计算快易准

功能入口:平台左侧菜单栏【计算方案】->【大方案】->【量化计算】->【量化计算(Gaussian 09)】

3. 平台操作步骤

  1. 上传分子结构文件

    上传具有良好3D结构的分子文件,支持mol、mol2、pdb、sdf和sd格式。

  2. 设置净电荷、自旋多重度和选择溶剂模型

    此三项为统一设置,对所有分子有效。因此,上传的分子结构须具有同一性质,不同性质(如,电荷)的分子结构应分别建立任务进行计算。

    • 自选多重度 = 单电子数 + 1。除了自由基、三线态氧及激发态等特殊情况,绝大多数有机化合物的自选多重度都是1。
    • 溶剂模型为预设项,须指定溶剂方有效,详见下面介绍。
  3. 设置计算步骤

    添加计算步骤,选择作业类型理论方法基组环境。各作业类型的含义是:

    • Optimization:几何优化
    • Frequency:振动频率分析
    • ECD/UV:ECD/UV计算
    • NMR:NMR计算
    • ORD:旋光色散计算,即比旋光度计算。
    • 多个步骤会自上而下依次进行,每一步完成后都输出相应的数据,并依次保存在同一个文件中。
    • 今后还会继续增加Gaussian 09常用的作业类型。

  4. 添加高级配置

    个别作业类型还需额外设置。点击高级配置栏中的【添加】,在弹出的对话框中按提示设置。

    例如,ECD/UV计算需要选择激发态数目,默认为30个。激发态数目越多,ECD/UV图谱覆盖的波长范围越广(从长波长到短波长),同时,计算量(时间)也越大。

    又如,ORD计算需要指定入射波长。通常,实验所用的入射光线是钠灯D线,即589.3 nm。若有其他波长,可选择或填写。

  5. 点击【提交】,选择支付方式,点击【确认】,提交任务。

    注意:本方案为后付费模式,按每个分子的实际计算时间进行扣费,请确保账户余额足够。

    当可用余额< 100元时会发出预警通知,发生欠费时会发出欠费通知,严重欠费时会立即终止任务。默认为短信通知,可在平台左侧菜单栏【设置】->【消息提醒】->【计算】处设置其他通知方式。

  6. 文件列表可下载所有计算文件。

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