decoupler注释细胞类型

这篇博客介绍了在使用Decoupler时遇到的两个常见问题及解决方案:1) 如何正确进行矩阵和数组的展平操作,通过修改pre.py文件中的A1为flatten();2) 如何处理matrix和array之间的转换问题,只需删除method_ora.py文件中报错行的.A。参考链接提供了详细的步骤和教程。
摘要由CSDN通过智能技术生成

使用decoupler时出现了两次报错

1.matrix和array中的展平操作

报错信息
解决方案

找到pre.py文件,将 A1改为flatten() 即可,详细解释可见
https://blog.csdn.net/qq_45100273/article/details/104729269

2.matrix和array的转换问题

解决方案
将method_ora.py文件中报错行的 .A 删除即可

参考教程:
https://scanpy-tutorials.readthedocs.io/en/latest/pbmc3k.html
https://decoupler-py.readthedocs.io/en/latest/notebooks/cell_annotation.html

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