GATK 部署
- 部署参考Github官方自述文件
移植GKL库
- 进入 gatk lib 目录
cd ${GATK}/build/libs
- 新建 gkl 目录
mkdir -p com/intel/gkl
- 解压移植的 gkl 加速库
unzip GKLcmtest.zip
- 将相关文件复制到 gkl 目录
cp -r GKLcmtest/* ./com/intel/gkl
- 将 gkl 加速库相关文件打入 jar 包
jar uxf gatk-package-${version}-local.jar com/intel/gkl/*