Singularity将本地SIF文件，转成sandbox

最新推荐文章于 2024-03-12 21:58:12 发布
最新推荐文章于 2024-03-12 21:58:12 发布
阅读量1.5k 收藏
点赞数
分类专栏： 计算机相关
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/zdx1996/article/details/109657257
版权

1.将本地SIF文件，转成sandbox
sudo singularity build --sandbox ./tmp/ your.sif

sudo singularity shell --writable ./tmp/

周迪新
关注
  • 0
    点赞
  • 踩
  • 0
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
专栏目录
singularity的镜像文件存在形式，以及它们的转换
qq_40256654的博客
02-21 256
特点: SIF是从Singularity 3.x版本开始引入的默认镜像格式。这是一个单文件格式，包含了容器的全部内容，包括操作系统、应用程序及其依赖项。SIF格式设计为不可变的，以确保安全和可重复性。用途: 由于其不可变性和单文件特性，SIF文件非常适合分发和共享。
singularity 利用 centos 构建sandbox, 并安装cnvnator（阿里云root）
qq_40256654的博客
02-28 185
在CentOS上安装Singularity的具体步骤可能会根据你的系统配置和Singularity版本有所不同，建议参考官方文档进行安装。这些步骤提供了一个大致的指导，具体细节（如依赖库的安装和ROOT的配置）可能需要根据你的具体环境和CNVnator的版本进行调整。完成以上步骤后，CNVnator应该已经在你的Singularity sandbox环境中安装完成。你可以通过执行CNVnator的命令来测试是否安装成功。进入Sandbox环境，安装CNVnator需要的依赖项，包括ROOT和其他工具。
Singularity入门之通过沙盒创建镜像
kongxx的专栏
07-31 3056
准备镜像目录 通过 “–sandbox” 选项指定一个目录来作为镜像运行目录。 $ sudo singularity -d build --sandbox ubuntu/ docker://ubuntu 运行并修改容器 在此镜像目录之上运行容器，这里需要使用 “–writable” 选项来使其可写。 $ sudo singularity shell --writable ubuntu/ # 在...
从Docker镜像创建Singularity镜像（SIF文件）
水木的编程生涯
08-15 3896
Singularity可以方便地处理Docker镜像，以下是三种方式： 方式1：从docker uri开始 参考：https://sylabs.io/guides/3.7/user-guide/singularity_and_docker.html#remotely-hosted-images 有以下两个命令可用： singularity pull docker://godlovedc/lolcow # 下载pre-built image singularity build mylolcow_latest.
浅谈Singularity容器
小男孩儿的博客
04-18 3956
1.容器简介 简而言之，容器是系统环境的封装。通常，容器技术被设计为解决企业的单一主要实例：微服务虚拟化。 Docker是最广为人知和使用最多的容器平台主要为网络微服务虚拟化而设计， 方便创建、维护和分发容器图像；容器是可以再生的；易于安装、记录完善、标准化。由于这些优势，Docker得到了广泛的使用 。它对当地和私人资源非常有用。你可以使用Docker-hub 来开发和分享你 的作品。如果您需要扩展到本地资源之外，这可能是一条死路！Docker 和其他以企业为中 心的容器不是为传统 H...
singularity 使用
qq_53666171的博客
08-29 1784
生信平台搭建之-singularity的运用
singularity-examples:示例奇异定义文件和演示
05-13
奇异例子该存储库包含定义文件，这些文件例示了奇异容器的不同使用模式。
containerize-conda：将现有的conda环境转换为Docker或Singularity容器
03-03
使用以下说明，可以将现有环境打包到Docker或Singularity容器中，该容器应具有更高的可移植性，并且还可以轻松地集成到基于的。先决条件Docker，Podman或Singularity 源conda环境必须在linux x64机器上。用法包装...
singularity-hpc:奇异容器的本地文件系统注册表（适用于HPC）
04-10
奇异注册表HPC（shpc） Singularity HPC基于 ，但并非旨在与Singularity容器和本地数据库进行常规交互，而是针对在HPC环境中管理容器进行了优化。 目前，这包括： 如果满足以下条件，则可以使用shpc： 希望将容器...
containers:Dockerfile和Singularity定义文件的集合，用于构建在Roar集群上使用的容器！
04-02
/singularity存储所有奇点定义文件的位置。 /share/doc用来帮助您开始使用Singularity和Docker的文档的存储位置。 /share/gifs您在本自述文件中看到的gif的存储位置。货柜清单现在，尽管您可以在/singularity或/...
IC卡dump文件转文本（支持转成MCT格式）
06-06
支持控制台模式，把文件拖到程序上就会直接转换（命令行那种，不是打开程序再拖，不过也可以），支持多文件拖放。dump和txt互换。如果要转换为MCT格式要先打开软件勾选了才可以。@Singularity。
Singularity（九）| 配置深度学习容器
最新发布
long_1998的博客
03-12 1194
例如，nvcc 是 CUDA 的编译器，用于将 CUDA C/C++ 代码编译为可在 GPU 上执行的二进制代码。R 的 TensorFlow 包会扫描系统中各种版本的 Python，还会扫描可用的虚拟环境和 conda 环境，所以在很多情况下，不需要我们进行额外的操作。要控制在 SingularityCE 容器中使用的 GPU，可以在运行容器之前设置 SINGULARITYENV_CUDA_VISIBLE_DEVICES，或者在容器内设置 CUDA_VISIBLE_DEVICES。
Singularity实践教程 + Docker 转 Singularity 的避坑指南
Qy_sfsh的博客
07-08 9423
因研究需要，复现某论文，使用的是某校的服务器集群。他们服务器使用的容器是Singularity，而之前自己在院里用的时docker。docker学了没多久，就开始Singularity。恰恰是会一点docker，所以在转用singularity的过程中，踩的坑比较多（造孽啊）。记录一下，前事不忘，后世之师.........
Docker镜像（本地tar文件）创建Singularity镜像（SIF文件）报错：FATAL: While performing build: conveyor failed to get: l
WLDLSW的博客
08-12 828
Docker镜像（本地tar文件）创建Singularity镜像（SIF文件）报错：FATAL: While performing build: conveyor failed to get: loading tar component manifest.json: archive/tar: invalid tar header解决办法
singularity使用简介
博客
07-13 2205
singularity与docker功能相似，但是相比与docker需要root权限，或者专门添加用户组，singularity在非root时也可使用，且轻量级，修改方便。
Singularity安装和使用
weixin_34110749的博客
07-06 6725
2019独角兽企业重金招聘Python工程师标准>>> ...
在CentOS上安装Singularity高性能容器
Dechin的博客
01-14 1668
什么是singularity容器 Singularity是劳伦斯伯克利国家实验室专门为大规模、跨节点HPC和DL工作负载而开发的容器化技术。具备轻量级、快速部署、方便迁移等诸多优势，且支持从Docker镜像格式转换为Singularity镜像格式。除了兼容docker的镜像之外，singularity还有一个不太明显的优势：可以通过非root帐号来拉起容器，这样对于某些安全性要求比较高的场景来说...
Singularity 快速上手, 带你飞
哒哒哒哒 哒哒
10-07 6740
Singularity 快速上手Singularity介绍先用ubuntu:16.04镜像体验一下如何使用singularity获取镜像：运行镜像：创建实例：查看实例：停止实例：以 ubuntu16.04作为基础镜像创建容器安装singularity(本地计算机)部分：SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能，丰富你的文章UML 图表FLowchart流程图导出与导入导出导入 Singularity介绍 Singularity 是一种容器技术
singularity使用
07-25
Singularity是一个容器解决方案，用于在高性能计算环境中运行应用程序和工作负载。它类似于Docker，但专为科学计算和研究领域设计。 使用Singularity可以轻松地在不同的计算机上复制和部署应用程序，而无需担心环境依赖性和配置问题。以下是一些使用Singularity的常见步骤： 1. 安装Singularity：首先，您需要将Singularity安装在您的系统上。可以参考Singularity官方文档以了解适用于您操作系统的安装步骤。 2. 创建容器：使用Singularity，您可以创建自定义的容器，其中包含您需要运行的应用程序和工作负载。您可以基于现有的Docker镜像创建Singularity容器，或者从头开始创建一个新的容器。 3. 构建容器：使用Singularity命令行工具，您可以构建和配置容器。您可以指定所需的操作系统、软件包和环境变量等。您还可以通过定义Singularity文件（如.def文件）来描述容器的配置。 4. 运行容器：一旦容器构建完成，您可以使用singularity run命令来运行容器。您需要指定要运行的应用程序或命令，并可以传递参数和选项。 5. 共享容器：如果您想与其他用户共享容器，可以使用singularity build命令将容器打包为一个可执行的文件，并将其共享给其他用户。 总的来说，Singularity提供了一种简单而有效的方式来管理和运行科学计算和研究工作负载。您可以根据自己的需求定制容器，并轻松地在不同的计算机上复制和部署应用程序。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值