文章目录
9. 原核生物表达调控
9.1 基因表达与调控的基本概念与原理
- 基因组 (genome):一个细胞或病毒所携带的全部遗传信息或整套基因。
- 基因表达 (gene expression):基因经过转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白质分子或 RNA 分子的过程。
- 基因表达调控 (gene regulation):基因表达是受内源及外源信号调控的。一般而言的基因表达调控是指转录水平调控。
基因表达的时空特异性
● (一) 时间特异性
- 按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达的时间特异性 (
temporal specificity
)。 - 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性 (
stage specificity
)。 - 人体发育过程中不同类型珠蛋白的含量变化:
● (二) 空间特异性
- 在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间顺序出现,称之为基因表达的空间特异性 (
spatial specificity
)。 - 基因表达伴随空间顺序所表现出的这种分布差异,实际上是由细胞在器官的分布决定的,所以空间特异性又称细胞或组织特异性 (
cell or tissue specificity
)。
基因表达的方式
● 按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:
(一)组成性表达 (constitutive expression)
- 某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持续表达,通常被称为管家基因 (
housekeeping gene
)。如 DNA 聚合酶、RNA 聚合酶等。 - 对于细胞结构和代谢是必须的(例如 rRNA, actin, tubulin) 。
- 通常表达水平高,但是表达水平也会改变。
- rRNA, actin, tubulin are commonly used as loading control in RT-PCR or Northern blot
(二) 诱导和阻遏表达
- 在特定环境信号刺激下,相应的基因被激活,基因表达产物增加,这种基因称为可诱导基因 (
inducible genes
)。如 β-半乳糖苷酶。 - 如果基因对环境信号应答是被抑制,这种基因是可阻遏基因 (
repressible genes
)。 - 基因表达调控大多数是对这些基因的转录和翻译速率的调节,从而导致其编码产物的水平发生改变,影响其功能。
基因表达调控的生物学意义
- 维持细胞增殖、分化
- 维持个体生长、发育
- 适应环境变化
基因转录调节基本要素
1)RNA 聚合酶 (RNA Polymerase)
2)特异 DNA 序列 (cis-acting elements
3)调节蛋白 (trans-acting factors)
启动子、调节序列和调节蛋白通过 DNA-蛋白质相互作用、蛋白质-蛋白质相互作用(最终)影响 RNA 聚合酶活性。
原核生物和真核生物基因表达调控差别
一般而言,基因表达调控主要分为转录水平上的调节,即:RNA 合成的多少,和转录后水平的调控(包括 mRNA 加工成熟水平上的调控和翻译水平上的调控)。
★ 原核生物调控的主要特点
- 原核生物基因表达调控主要是转录水平的调控。
- 可分为正调控和负调控两种。
- 可诱导调节:乳糖操纵子 等,操纵子总是一些编码分解代谢糖和氨基酸的蛋白质的基因,这些操纵子常常是关闭的。
- 可阻遏调节:色氨酸操纵子 等,可阻遏基因常常是一些合成各种细胞代谢过程中所必须的合成小分子物质(如氨基酸、嘌呤和嘧啶等)的基因。这些基因平时总是打开的。
- 降解物可以抑制基因转录:葡萄糖通过抑制腺苷酸环化酶的活性减少环腺苷酸的合成来抑制乳糖、半乳糖等操纵子。
● 操纵子 (Operon
):临近的、功能相关的、被协同调控的基因。
9.2 原核生物转录水平的调控 (transcriptional regulation)
9.2.1 乳糖操纵子 (lac)
- 大肠杆菌乳糖操纵子 (
lactose operon
) 包括 3 个结构基因:
lacZ
、lacY
和lacA
,以及启动子、控制子和阻遏子等。 - 3 个结构基因各决定一种酶:
lacZ
编码 β-半乳糖苷酶,将乳糖水解为半乳糖和葡萄糖。
lacY
编码 β-半乳糖苷透过酶,使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)透过大肠杆菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
lacA
编码 β-半乳糖苷乙酰基转移酶,把乙酰辅酶 A 上的乙酰基转移到 β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖,能稳定半乳糖及其类似物如 IPTG 不被降解。 - 转录时,RNA 聚合酶首先与启动区 (promoter,
P
) 结合,通过操纵区(operator,O
) 向右转录。转录从 О 区中间开始,按lacZ→lacY→lacA
方向进行,每次转录出来的一条 mRNA 上都带有这 3 个基因。转录的调控是在启动区和操纵区进行的。 - 这三种酶的基因聚在一起,通过一个启动子一起转录,产生多顺反子。它们在功能上相连,因此在表达上也相连。它们同时被关闭和打开。Negative control 使乳糖操纵子在没有乳糖时受到抑制,positive control 使乳糖操纵子在葡萄糖存在时相对不活跃,即使乳糖存在。
乳糖操纵子调控模型
(1) lacZ、lacY、lacA 基因的产物由同一条多顺反子的 mRNA 分子所编码。
(2) 该 mRNA 分子的启动区 P 位于阻遏子 Repressor
(lacI
) 与操纵区 O 之间,不能单独起始半乳糖苷酶和透过酶基因的高效表达。
(3) 操纵区是 DNA 上的一小段序列(仅为 26 bp), 是阻遏物的结合位点。
(4) 当阻遏物与操纵区相结合时,lac mRNA 的转录起始受到抑制。
(5) 诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵区相结合,从而激发 lac mRNA 的合成。也就是说,有诱导物存在时,操纵区没有被阻遏物占据,所以启动子能够顺利起始 mRNA 的转录。
● 乳糖操纵子模型的补充
- 真正的诱导物是 异构乳糖(葡糖-1,6-半乳糖),而不是乳糖(葡糖-1,4-半乳糖)
- 在非诱导状态时细胞内有少量的 β半乳糖苷酶(能让乳糖变为异构乳糖)和 β半乳糖苷透过酶 mRNA 和蛋白的本底组成性表达