【听课笔记】复旦大学遗传学_08遗传分析方法

课程地址： 复旦大学遗传学

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八、遗传分析方法

8.1 模式生物遗传分析策略与方法

• 如何解决一个感兴趣的遗传学问题？
• 如何设计基本的研究思路与方法？
• 如，作物的抗逆性：抗寒、抗旱、抗盐、抗病虫害是由什么遗传机制决定的？应该如何进行研究？
  

8.1.1 正向遗传学

• 正向遗传学基本思路：
  1. 选择一个合适的科学问题。如，我们关心红色面包霉的物质合成代谢途径。
  2. 随机诱变。如，利用射线对红色面包霉进行随机诱变。
  3. 表型筛选。观察哪些诱变后的菌株符合目标表型，如不能合成某个氨基酸或维生素等。
  4. 基因定位。从突变菌株中鉴定突变基因的染色体位置及突变信息、功能信息等。
  

• 正向遗传学 (forward genetics) 指的是通过生物个体或细胞的基因组的自发突变或人工诱变，首先寻找相关的表型或性状改变，然后从这些特定性状变化的个体或细胞中找到对应的突变基因，并揭示其功能的研究方法。从表型到基因型的研究策略

• 案例：果蝇发育机制的研究——海德堡筛选
  1. 随机诱变。用 EMS（甲基磺酸乙酯，烷化剂，引起碱基配对改变）处理果蝇。

  2. 突变品系培育。利用杂交和自交得到每个突变品系的杂合子和纯合子。
  ■ 由于诱变是随机且低剂量的，通常 F0 代果蝇只携带一个拷贝的基因突变，因此要先将突变果蝇 F0 与野生型做单对杂交得到携带相同突变的 F1 代果蝇，F1 代自交后在 F2 代中得到各个突变品系的杂合子和纯合子。

  3. 表型筛选。观察 F2 代胚胎发育过程，选择出现胚胎发育异常的个体，观察和分析特定的表型变化。
  4. 基因定位与功能分析。对这些基因进行定位，寻找能决定这些胚胎发育事件的基因。
  母体效应基因 maternal effect gene
  裂隙基因 gap gene
  成对规则基因 pair-rule gene
  体节极性基因 segment polarity gene
  同源异形基因 homeotic gene
  

• 正向遗传学方法的优点
  1. 没有主观偏向，随机诱变基因组各基因。
  2. 在表型筛选中可一次得到大量不同类型的突变体，易于在短时间内克隆大量基因。

• 正向遗传学方法的缺点
  1. 理论上不可能诱变基因组的全部基因。
  2. 不可能一次筛选到与性状相关的全部基因。
  3. 遗传突变通常是不可逆、不可控的，活性无法按照研究者的愿望进行转换。
  4. 哺乳动物等不适合随机诱变。

8.1.2 反向遗传学

• 反向遗传学基本思路：
  1. 选择问题。如，植物叶子的形态。
  2. 确定基因。选择和明确想要研究的基因，如通过文献检索，在一些物种中已知某些基因参与了叶子形态的调节，现在研究的物种中有同源基因。或者通过数据库，直接寻找突变体信息。
  3. 基因突变或表达。针对目的基因进行定点突变或过量表达，即破坏内源性基因的功能或添加外源性基因的作用。
  4. 表型变化分析。观察经过基因操作后，叶子的形态是否发生预期的表型变化。
  

• 反向遗传学 (reverse genetics) 指的是在生物个体或细胞内改变某个特定的基因或蛋白质，然后再去寻找有关的表型变化&