生物信息学
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taotaotao7777777
这个作者很懒,什么都没留下…
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【影像组学】从特征筛选到分类建模全流程实践及作图
1. 数据准备2. 特征权重图3. 特征相关性热度图 heatmap4. LASSO 模型中 Lambda 选值图5. 特征系数随 Lambda 变化曲线6. 随机森林分类器7. ROC 曲线8. 精确度(Precision),敏感度(Sensitivity),特异度(Specificity)等输出......原创 2022-06-19 20:40:43 · 7862 阅读 · 8 评论 -
【影像组学】分类器模型设计- 随机森林 + 支持向量机
分类器模型设计- 随机森林 + 支持向量机原创 2022-06-19 19:10:09 · 3654 阅读 · 0 评论 -
【影像组学】windows系统安装pyradiomics包的问题
pyradiomics 包的 官方文档 提示,只适用于 python 3.5, 3.6 or 3.7(windows系统),因此需要先确认安装的python版本。cmd 中输入 python 即可查看。python 版本降级方法一:打开 Anaconda Navigatior 按下图设置。python 版本降级方法二:在anaconda prompt中输入 conda create -n downgrade python=3.7 anaconda安装 pyradiomics 包:cmd 中输入..原创 2022-06-17 00:35:13 · 1631 阅读 · 2 评论 -
【影像组学】影像组学特征筛选和降维(T检验+LASSO+PCA)
导入数据t 检验特征筛选t 检验后数据处理LASSO 特征筛选4. 特征降维:主成分分析法 (PCA)主成分分析,PCA = Principle component analysis矩阵乘法◆ 一个 m 行 n 列的矩阵,与一个 n 行 r 列的矩阵相乘(前面的矩阵列数必须与后面的矩阵行数相等,否则不能相乘),将得到一个 m 行 r 列的矩阵: Dm×n × Tn×r = Pm×r◆ 在影像组学中, 对应病例数, 对应原始提取出的特征数,主成分分析法就是 以一个合原创 2022-06-16 15:34:11 · 11049 阅读 · 5 评论 -
【影像组学】用3Dslicer或Python提取影像组学特征
用3Dslicer或Python提取影像组学特征原创 2022-06-15 13:31:14 · 13879 阅读 · 11 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-08 编程基础与网页制作
山东大学生物信息学,编程基础与网页制作原创 2022-06-14 02:16:28 · 436 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学——Perl 语言基础入门+高级
生物信息学——Perl 语言基础入门+高级原创 2022-06-13 21:30:17 · 1965 阅读 · 0 评论 -
【影像组学】基于 atlas 感兴趣区提取 (3D slicer)
基于 atlas 感兴趣区提取 (3D slicer)原创 2022-06-13 14:53:37 · 1360 阅读 · 3 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-07 数据挖掘(WEKA)
7.1 数据库系统7.2 机器学习7.3 WEKA7.3.1 ARFF 文件的格式7.3.2 ARFF 属性类型与格式转换7.3.2 数据准备:Explorer 界面介绍7.3.3 数据预处理7.3.4 执行挖掘任务原创 2022-06-13 14:50:04 · 948 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-05 高通量测序技术介绍 + 06 统计基础与序列算法(原理)
05 高通量测序技术介绍 + 06 统计基础与序列算法原创 2022-06-12 01:27:57 · 773 阅读 · 0 评论 -
Python 入门的60个基础练习
Python 入门的60个基础练习原创 2022-06-11 20:51:44 · 43215 阅读 · 15 评论 -
Python 入门及实践
影像组学入门及实践 4 python入门及实践原创 2022-06-11 00:44:35 · 562 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-04 蛋白质结构预测与分析
蛋白质结构预测与分析原创 2022-06-09 16:55:25 · 3843 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-03 分子进化与系统发生
系统发生树原创 2022-06-08 15:54:17 · 695 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-02 序列比较
山东大学生物信息学-02 序列比较原创 2022-06-08 01:03:10 · 4356 阅读 · 0 评论 -
【学习笔记】山东大学生物信息学-01 生物数据库
01 生物数据库原创 2022-06-02 16:54:20 · 2429 阅读 · 0 评论