linux系统下安装pfam数据库中hmmer软件以及python3非root用户的安装

linux系统下安装pfam数据库中hmmer软件以及python3非root用户的安装
http://hmmer.org/从该链接下载源,其中有Userguide.pdf
下载,解压缩并切换目录

来自官网,下载,解压缩并切换目录
来自官网,编译环境
来自官网,需要有python3环境
之前已下载python3,但是一直没安装成功。
从头开始下载安装参考这篇博客:https://www.cnblogs.com/jimlau/p/12049808.html
首先创建目录
mkdir -p /home/jyzheng/software/python3.6
编译安装
./configure --prefix="/home/jyzheng/software/python3.6"(非root用户都可使用该条命令)
make
make install
添加环境变量
vim .bashrc
添加该语句
alias python3=/home/jim/software/python3.6/bin/python3.6
alias pip3=/home/jim/software/python3.6/bin/pip3.6
由于添加该语句后执行make check命令仍然报错,显示没有python3路径,所以再添加该语句
export PATH=/home/jyzheng/software/python3.6/bin:$PATH
一定要添加到bin目录下,可能是因为执行文件在该目录吧
执行该命令:
source .bashrc
注意:.bashrc文件在~目录下
切换到hmmer-3.3.1目录,执行:
make check
make install
成功!
下一篇应该就是hmmer的使用,以这样的方式记录学习的点滴,希望能有进步吧!

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