MaXFlow分子模拟与人工智能平台

最新推荐文章于 2024-07-12 16:55:56 发布
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文章标签： 人工智能 机器学习 深度学习
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Q：机器学习或深度学习的训练使用数据量大概多少，预测精确度如何？是否会使用一些已知的数据进行测试？

A: 针对不同的预测模型，我们采用权威的开源数据库进行训练，如对于逆合成路线预测，我们使用USPTO-50k数据库上的所有相关数据进行训练。对于精确度我们已经在尝试通过近期已报道的文献进行相关测评，如图所示为使用MaXFlow预测文献中化合物的合成路线与实际路线的对比，结果表明MaXFlow的预测结果与文献一致。

Q：抗原抗体对接是刚性对接吗，准确率如何？

A: 目前MaXFlow是刚性对接，采用MEGADOCK引擎，其针对特殊的抗体结构会进行构象优化。同时MEGADOCK使用多种技术减少对接所需的计算时间，例如一种新的评分函数，称为真正的成对形状互补(rPSC)评分。研究表明完成对接计算的PPI筛选，MEGADOCK的穷举能力比传统对接软件ZDOCK快7

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zzl18864612032
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生命科学 MaXFlow 分子模拟与人工智能平台
zzl18864612032的博客
03-29 86
为了评估生成分子的新颖性，MaXFlow通过ISOMAP算法应用于从ZINC数据库获得的训练数据集，构建从指纹到二维空间的映射，灰点代表ZINC数据库中的分子，热图点代表生成分子随时间的分布，从而实现生成新颖分子的评估。目前动力学模拟部分不仅支持基础的理化性质分析、骨架波动分析（RMSD、RMSF），还将支持蛋白质二级结构分析、热点残基分析（丙氨酸扫描、能量分解）、结合自由能分析（FEP自由能、MMPBSA）、相互作用分析（氢键分析、盐桥分析）、构象转变分析等，可以从不同角度给出相互作用全面的分析。
生命科学-2022年8月 MaXFlow分子模拟与人工智能平台
zzl18864612032的博客
04-27 123
为了评估生成分子的新颖性，MaXFlow通过ISOMAP算法应用于从ZINC数据库获得的训练数据集，构建从指纹到二维空间的映射，灰点代表ZINC数据库中的分子，热图点代表生成分子随时间的分布，从而实现生成新颖分子的评估。目前动力学模拟部分不仅支持基础的理化性质分析、骨架波动分析（RMSD、RMSF），还将支持蛋白质二级结构分析、热点残基分析（丙氨酸扫描、能量分解）、结合自由能分析（FEP自由能、MMPBSA）、相互作用分析（氢键分析、盐桥分析）、构象转变分析等，可以从不同角度给出相互作用全面的分析。
分子模拟与人工智能平台——MaXFlow
zzl18864612032的博客
04-04 226
如果是对数据保密性要求较高的用户，我们也提供本地部署版的MaxFlow，为用户搭建网络、软件、硬件整体环境，负责前期实施与后期维护等服务。使用MaxFlow中的结构分析组件 ，可分析作用前后的结构性质变化（如：结合前后的化学键长度变化、径向分布函数RDF等），评价涂层与基体之间的结合效果。对于交联反应的重现，可以使用MaxFlow中的高分子交联组件完成，通过设置特定参数、原子类型、反应分子、交联率等信息，即可模拟交联反应的动力学过程，从而得到一定交联率的树脂交联模型。· 模型共享，专家经验与知识沉淀固化。
MaXFlow人工智能与分子模拟平台在锂电池领域中的应用
onetwotwothree_的博客
03-09 793
MaXFlow人工智能与分子模拟平台在锂电池领域中的应用 随着高性能计算、大数据、云计算、机器学习、人工智能（AI）等技术的快速蓬勃发展，许多行业的领导者正使用数字化解决方案重新定义产品创新。通过引入人工智能和虚拟仿真等数字化手段，实现传统经验驱动到数字驱动的研发理念转变，有效降低研发成本，提高研发效率，加快产品上市。这一数字化解决方案也可很好地应用于新型储能器件的研发，快捷地实现基于有限工作量，提高科学生产力，创造行业价值。 创腾科技自主研发的MaXFlow分子模拟与人工智能平台基于浏览器-服务器(B
第十一届国际分子模拟与人工智能应用学术会议 （2023-ICMS&AI）
zzl18864612032的博客
03-08 1308
作为国内历史悠久、分子模拟领域公认的高水平国际学术会议，国际分子模拟与人工智能应用学术会议重磅回归。经过两年的精心筹备，本次会议将于2023年5月6日-7日在成都隆重举行，本次大会将为国内外从事分子模拟人工智能应用和研发创新数字化转型的企业、高校、科研机构的专家与学者，提供最为广泛的交流与合作平台。本届大会主题：洞悉微观，预见未来。
“让材料分子模拟插上AI的翅膀”——MaXFlow3.5
onetwotwothree_的博客
05-01 696
“让材料分子模拟插上AI的翅膀”——MaXFlow3.5 重磅发布 随着我国重点产业及战略性新型产业的飞速发展，新材料的研发、设计面临着严峻挑战——研发难度前所未有，创新难度不断加大，基于理论研究、实验分析及计算仿真的传统方法已经无法满足高性能材料的发展需求！ 近年来，机器学习在新材料研发领域的突破性进展，掀起了传统材料研发模式的全新变革！机器学习采用先进的数据挖掘方法对海量材料数据进行分析，缩短了材料研发周期、降低了试验过程中的错误率和研发成本，极大地加快了新材料的研发进度。 那么，如何将人工智能、
MaXFlow3.5新功能“剧透”：“AI+分子模拟”，开启科学研发范式变革
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05-06 583
MaXFlow3.5新功能“剧透”！“AI+分子模拟”，开启科学研发范式变革 在经历了实验驱动、理论驱动、计算驱动之后，以“大数据”、“人工智能”为标志的数据驱动将成为科学研究方法的“第四范式”！ 在材料科学领域 亟需打造材料科学理论、人工智能、计算机科学和云计算等先进信息技术协同驱动的材料研发新技术、新手段，形成材料高通量实验、高通量计算和材料数据库融合的材料创新体系和智能研发模式，探寻打开材料“基因”的钥匙，帮助科学家实现“按需设计”！ 在生命科学领域 伴随着AIDD（AI Drug
当「分子模拟」遇到「人工智能」，怎样更容易擦出火花？
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01-21 2167
当「分子模拟」遇到「人工智能」，怎样更容易擦出火花？ 随着算力的大幅提高以及大数据时代的来临，科学研发的创新范式从最初神农尝百草式的经验驱动，逐渐过渡为利用计算模拟和机器学习从数据中挖掘信息，创腾科技MaXFlow人工智能创新平台应运而生，旨在帮助用户能够更“自由”地使用先进的算法和工具。 伴随着这一全新平台的诞生，诸多话题引发业内人士的广泛关注。MaXFlow同传统的分子模拟软件有什么区别？人工智能在MaXFlow中又是如何体现的？工作流又是如何在其中起到关键性作用的？本期的访谈中，我们邀请到了创
基于分子模拟对Mn-SOD稳定性的研究
onetwotwothree_的博客
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摘要：本文研究了通过突变提高Mn-SOD的热稳定性。文章借助DS中的同源建模模块构建出Mn-SOD的三维结构，通过虚拟氨基酸突变的方法设计了三类突变，包括单点突变，双点突变和三点突变，并利用DS中的分子动力学模块进行了分子动力学模拟进行验证了Mn-SOD结构稳定的突变，单点突变（Glu 215Trp），双点突变（Val140Leu, Glu215Trp）， 三点突变（Val140Leu, Glu155Trp, Glu215Trp），最后通过实验的方法进行了验证通过突变的方式可以提高Mn-SOD的稳定性。
maxflow mincut
07-19
Definition Ford-Fulkerson Algorithm Max-Flow/Min-Cut Theorem
网络模式MaxFlow
10-17
网络模式Maxflow, 最短路径问题, 最小扩张树问题, 最大流量问题
Max-flow.zip_MATLAB交通_max_max flow matlab_交通流量_流量
07-13
总的来说，"Max-flow.zip"这个压缩包提供了使用MATLAB解决最大流量问题的工具，对于理解交通网络的流量优化和规划具有重要的理论与实践价值。通过深入学习和应用，不仅可以提升对图论和网络流的理解，还能为实际交通...
M.rar_The First_maxflow_weight
09-14
Implementation of Edmonds Karp algorithm that calculates maxFlow of graph. Input: For each test case, the first line contains the number of vertices (n) and the number of arcs (m). Then, there exist m...
maxflow算法
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论文An Experimental Comparison of Min-Cut/Max-Flow Algorithms for Energy Minimization in Computer Vision的图割法程序。min-cut/max-flow实现图像的分割。
OpenSNN推文：近期优质博客推荐汇总
最新发布
opensnn的博客
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国内个人博客站点众多，涵盖了技术、生活、艺术等多个领域。
AGI 之 【Hugging Face】 的【问答系统】的 [构建问答系统] / [ 构建基于评论的问答系统 ] 的简单整理
仙魁XAN
07-12 818
AGI，即通用人工智能（Artificial General Intelligence），是一种具备人类智能水平的人工智能系统。它不仅能够执行特定的任务，而且能够理解、学习和应用知识于广泛的问题解决中，具有较高的自主性和适应性。AGI的能力包括但不限于自我学习、自我改进、自我调整，并能在没有人为干预的情况下解决各种复杂问题。AGI能做的事情非常广泛：跨领域任务执行：AGI能够处理多领域的任务，不受限于特定应用场景。自主学习与适应：AGI能够从经验中学习，并适应新环境和新情境。
聊聊如何在内网下构建大模型微调环境
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LlamaFactory新版更新后，还是比较方便，只是说llamafactory-cli命令的确是有点蒙，踩个坑就好了。对于LlamaFactory微调来说，本身不难，毕竟都是配置；主要是在内网环境下的依赖包拉取安装是真麻烦，但其实也还好。走一遍的话，还是可以学到很多的。​。
人力资源人工智能依赖于良好的数据
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3DS MAX建模.pdf
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