生命科学 MaXFlow 分子模拟与人工智能平台

MaXFlow是一个分子模拟与人工智能平台,用于生命科学研究。它利用机器学习和深度学习技术进行预测,如逆合成路线、抗原抗体对接,并支持细致的相互作用分析。平台通过ISOMAP评估生成分子的新颖性,使用多种成药性指标进行评价,并具备抗体的CDR区注释和优化功能。MaXFlow旨在提高建模效率,降低研发成本。
摘要由CSDN通过智能技术生成

:机器学习或深度学习的训练使用数据量大概多少,预测精确度如何?是否会使用一些已知的数据进行测试?

:针对不同的预测模型,我们采用权威的开源数据库进行训练,如对于逆合成路线预测,我们使用USPTO-50k数据库上的所有相关数据进行训练。对于精确度我们已经在尝试通过近期已报道的文献进行相关测评,如图所示为使用MaXFlow预测文献中化合物的合成路线与实际路线的对比,结果表明MaXFlow的预测结果与文献一致。


 

问:抗原抗体对接是刚性对接吗,准确率如何?

答:目前MaXFlow是刚性对接,采用MEGADOCK引擎,其针对特殊的抗体结构会进行构象优化。同时MEGADOCK使用多种技术减少对接所需的计算时间,例如一种新的评分函数,称为真正的成对形状互补(rPSC)评分。研究表明完成对接计算的PPI筛选,MEGADOCK的穷举能力比传统对接软件ZDOCK快7.5倍,计算结

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