群体遗传学中衡量群体间分化程度的指标有很多种,最常用的就是Fst指数。
Fst指数,由F统计量演变而来。F统计量(FIS,FIF,FST)主要有三种。
Fst是针对一对等位基因,如果基因座上存在复等位基因,则需要用Gst衡量,
基因差异分化系数(gene differentiation coefficient,Gst)。
假定有s个地方群体,第k个地方群体相对大小为wk,第k个地方群体
中第i个等位基因频率为qk(i),杂合体频率观察值为hk,那么整个群体
中观察到的杂合体频率平均值HI,地方群体为理想群体的期望杂合
体频率平均值HS,整个群体为理想群体的期望杂合体频率HT,分别
为:
FIS,是HI相对于HS减少量的比值,即地方群体的平均近交系数。