基因编辑技术中cas9和cas12的区别与联系

如上图所示，CRISPR-Cas9和CRISPR-Cas12是两种常用的基因编辑技术，它们在作用机制、DNA切割特异性、应用范围等方面存在一些区别和联系。

1. 作用机制：

   • Cas9：通过引导RNA（gRNA）与目标DNA序列特异性结合，形成DNA双链断裂（DSB）。Cas9在DSB位点引发DNA修复过程，进而实现基因敲除或敲入。
   • Cas12：与Cas9相比，Cas12具有更宽泛的DNA切割特异性，不需要额外的tracrRNA，而只需要一个单一的引导RNA（sgRNA）。Cas12同样在目标DNA位点引发DSB。

2. DNA切割特异性：

   • Cas9：具有较高的特异性，需要PAM序列（Protospacer Adjacent Motif）作为识别信号，通常为NGG或NAG。
   • Cas12：对PAM序列的要求更为宽松，如FnCpf1对PAM序列没有严格要求，而LbCpf1对PAM序列的要求与Cas9相似。

3. 应用范围：

   • Cas9：广泛应用于各种生物体的基因编辑，包括植物、动物、微生物等。
   • Cas12：由于其更宽泛的DNA切割特异性，在某些情况下可能更适合特定应用，如植物基因编辑中的非特异性切割，或是在某些难以使用Cas9进行编辑的生物体中。

4. 脱靶效应：

   • Cas9：存在一定的脱靶效应，这是基因编辑技术中需要关注的问题。
   • Cas12：脱靶效应可能比Cas9更为显著，因此在设计和应用时需要特别注意。

5. 引导RNA的设计：

   • Cas9：需要设计tracrRNA和gRNA的嵌合体。
   • Cas12：只需要设计一个sgRNA，简化了引导RNA的设计过程。

总体来说，Cas9和Cas12都是强大的基因编辑工具，各有优势和适用范围。选择使用哪种系统通常取决于具体的研究目的、实验条件和目标生物体的特性。随着基因编辑技术的不断进步，未来可能会有更多基于CRISPR的核酸酶系统被开发出来，提供更多样化的编辑选择。