- 博客(14)
- 收藏
- 关注
转载 docker pull 镜像失败报错failed to register layer: no space left on device
docker pull镜像,第一次pull镜像就提示no space left 间不足,我在/etc/docker/daemon.json文件中配置了加速器。原文链接:https://blog.csdn.net/weixin_41948075/article/details/123941754。4、编辑/etc/docker/daemon.json 添加 "root-data": “/docker/data”找到Docker Root Dir: /var/lib/docker,没修改前我的是这个地址。
2024-05-01 10:20:42 52
原创 临床预测模型
列线图是一种建立在多因素Cox回归模型(或者其他多因素回归模型)基础上,通过带有刻度的线段按一定比例将各种预测指标列在一张平面图上,然后对每一个因素进行打分,将所有因素的得分相加得到总分,用这个总分来预测最终的结局。C-index(concordance index),也有人翻译为一致性指数,主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度。P值小于0.05具有统计学意义,exp(coef)代表HR,大于1表示风险因素。c-index为0.69。
2024-02-27 21:37:57 228
原创 GEO数据库ID转换
作者:混迹天然 https://www.bilibili.com/read/cv14560979/ 出处:bilibili。在http://www.bio-info-trainee.com/1399.html网站获取平台探针与基因对应关系的R包。如果没有下载过这个包,就下载一下,代码如下(注意:网页里面的R包名称不是全称,要在后面加“.db”)通过上述方法我们得到了ID对应的symbol,接下来只需要将symbol列对应进矩阵就好了。
2024-02-05 22:39:56 175 1
原创 有用的命令
strsplitsymbol1 <- strsplit(symbol,split=" /// ",fixed=T)#fixed=T表示精确查找gene_symbol <- sapply(symbol1,function(x){x[1]})#提取每一个子列表中的第一个元素。
2024-01-26 22:14:57 113 1
原创 GEO :将ENTREZ_GENE_ID转换为gene symbol
【代码】GEO :将ENTREZ_GENE_ID转换为gene symbol。
2024-01-26 19:42:13 404 1
原创 GEO芯片数据处理、多芯片数据合并、差异分析、核心基因提取、核心基因与免疫细胞相关性
下载探针矩阵probe.txt和平台注释ann.txt查看分组信息,复制对照组样本名称s1.txt和实验组样本名称s2.txt。
2024-01-20 20:53:36 683
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人