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本文地址:https://blog.csdn.net/caroline_wendy/article/details/137009993
GitHub: https://github.com/bjing2016/alphaflow
AlphaFlow 是基于流的生成模型方法,用于学习和采样蛋白质的构象景观。这项工作,使用类似 AlphaFold 和 ESMFold 这样的高精度单态预测器,并且,在自定义的流匹配框架下,进行微调,以获得称为A lphaFlow 和 ESMFlow 的序列条件生成模型。在 PDB 上进行训练和评估,与 AlphaFold 结合 MSA 子采样相比,AlphaFlow 在精确度和多样性上,提供了更优的组合。当进一步,在全原子MD的集合上训练时,该方法准确地捕获了未见蛋白质的构象灵活性、位置分布和更高阶的集合可观测量。此外,该方法可以使静态的 PDB 结构多样化,并且,在平衡属性上,比复制 MD 轨迹更快地收敛,展示其作为昂贵物理基础模拟的代理的潜力。
1. 环境配置
自我介绍一下,小编13年上海交大毕业,曾经在小公司待过,也去过华为、OPPO等大厂,18年进入阿里一直到现在。
深知大多数嵌入式工程师,想要提升技能,往往是自己摸索成长或者是报班学习,但对于培训机构动则几千的学费,着实压力不小。自己不成体系的自学效果低效又漫长,而且极易碰到天花板技术停滞不前!
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最后
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