2024年运维最新基于conda环境下的宏基因组学分析利器MetaWRAP 1(3)，高级Linux运维面试答案

最全的Linux教程，Linux从入门到精通

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1. linux从入门到精通(第2版)

2. Linux系统移植

3. Linux驱动开发入门与实战

4. LINUX 系统移植 第2版

5. Linux开源网络全栈详解 从DPDK到OpenFlow

第一份《Linux从入门到精通》466页

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内容简介

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本书是获得了很多读者好评的Linux经典畅销书**《Linux从入门到精通》的第2版**。本书第1版出版后曾经多次印刷，并被51CTO读书频道评为“最受读者喜爱的原创IT技术图书奖”。本书第﹖版以最新的Ubuntu 12.04为版本，循序渐进地向读者介绍了Linux 的基础应用、系统管理、网络应用、娱乐和办公、程序开发、服务器配置、系统安全等。本书附带1张光盘，内容为本书配套多媒体教学视频。另外,本书还为读者提供了大量的Linux学习资料和Ubuntu安装镜像文件，供读者免费下载。

本书适合广大Linux初中级用户、开源软件爱好者和大专院校的学生阅读，同时也非常适合准备从事Linux平台开发的各类人员。

需要《Linux入门到精通》、《linux系统移植》、《Linux驱动开发入门实战》、《Linux开源网络全栈》电子书籍及教程的工程师朋友们劳烦您转发+评论

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1. 丰富的功能：MetaWRAP提供了多种功能，可以帮助用户从原始的测序数据到最终的生物学解释。
2. 灵活的使用方式：MetaWRAP支持命令行和Python API两种使用方式，用户可以根据自己的需求选择合适的方式使用。
3. 高效的计算性能：MetaWRAP采用了多线程和并行计算的方式，可以加快分析的速度。

总之，MetaWRAP是一个功能强大的宏基因组学分析工具库，可以帮助用户对宏基因组数据进行装配、注释和功能分析。它的使用方式灵活，计算性能高效，适用于各种宏基因组学研究的需要。

凡事先看文章：MetaWRAP—a flexible pipeline for genome-resolved metagenomic data analysis | Microbiome | Full Text

github目录：https://github.com/ursky/metaWRAP

anaconda地址：Login :: Anaconda.org

安装

这里还是介绍conda或mamba安装吧，其他的可能不是最新版，配置起来有时候比较麻烦

conda config --add channels defaults
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels ursky

# 

mamba config --add channels defaults
mamba config --add channels conda-forge
mamba config --add channels bioconda
mamba config --add channels ursky

安装的时候注意了，直接将所有channel都放上，不然缺包错误：

mamba create -y --name metawrap132 -c ursky -c bioconda -c conda-forge metawrap-mg=1.3.2

安装完最后的提示：

查看安装结果，主要看其中metawrap-mg的版本，这里是1.3.2，来自ursky：

mamba list

配置建议数据库

这里是各个数据库，数据库大小，以及各个模块可能使用到的数据库，按实际需求配置，如果没有配置对应数据库，则需要在后续模块中指定或着忽略对应参数：

taxonomy数据库：

# 先删除原配置文件夹
rm -rf /miniconda3/envs/metawrap132/opt/krona/taxonomy
# 自己创建指定文件夹
mkdir /path/on/big/disk/taxonomy
# 创建软链接
ln -s /path/on/big/disk/taxonomy /miniconda3/envs/metawrap132/opt/krona/taxonomy
# 自动下载更新数据库，会自动下载到自己指定的文件夹
ktUpdateTaxonomy.sh

直接查看ktUpdateTaxonomy.sh文件内容，直接下载来自ncbi数据库：

下载解压完成后，在目标目录生成一个taxonomy.tab的文件：

head taxonomy.tab 
1	0	1	    no rank	        root
2	2	131567	superkingdom	Bacteria
6	7	335928	genus	        Azorhizobium
7	8	6	    species	        Azorhizobium caulinodans
9	8	32199	species	        Buchnera     aphidicola
10	7	1706371	genus	        Cellvibrio
11	9	1707	species	        Cellulomonas gilvus
13	7	203488	genus	        Dictyoglomus
14	8	13	    species	        Dictyoglomus thermophilum
16	7	32011	genus	        Methylophilus

GRIDSS\SILVA 16S rRNA\BUSCO数据库

quast-download-gridss
quast-download-silva
quast-download-busco

下载后位于目录：

/miniconda3/envs/metawrap/lib/python2.7/site-packages/quast_libs/

下载日志：

envs/metawrap/lib/python2.7/site-packages/quast_libs/silva/blastdb.log

为了做好运维面试路上的助攻手，特整理了上百道 【运维技术栈面试题集锦】 ，让你面试不慌心不跳，高薪offer怀里抱！

这次整理的面试题，小到shell、MySQL，大到K8s等云原生技术栈，不仅适合运维新人入行面试需要，还适用于想提升进阶跳槽加薪的运维朋友。

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• 35道Jenkis面试题
• 78道MongoDB面试题
• 17道ansible面试题
• 60道dubbo面试题
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• 40道nginx面试题
• 77道redis面试题
• 28道zookeeper

总计 1000+ 道面试题， 内容 又全含金量又高

• 174道运维工程师面试题

1、什么是运维?

2、在工作中，运维人员经常需要跟运营人员打交道，请问运营人员是做什么工作的?

3、现在给你三百台服务器，你怎么对他们进行管理?

4、简述raid0 raid1raid5二种工作模式的工作原理及特点

5、LVS、Nginx、HAproxy有什么区别?工作中你怎么选择?

6、Squid、Varinsh和Nginx有什么区别，工作中你怎么选择?

7、Tomcat和Resin有什么区别，工作中你怎么选择?

8、什么是中间件?什么是jdk?

9、讲述一下Tomcat8005、8009、8080三个端口的含义？

10、什么叫CDN?

11、什么叫网站灰度发布?

12、简述DNS进行域名解析的过程?

13、RabbitMQ是什么东西?

14、讲一下Keepalived的工作原理?

15、讲述一下LVS三种模式的工作过程?

16、mysql的innodb如何定位锁问题，mysql如何减少主从复制延迟?

17、如何重置mysql root密码?

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置mysql root密码?

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