随机生存森林的模型建立和结果解读

最新推荐文章于 2024-07-01 16:06:56 发布
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分类专栏： 临床预测模型 文章标签： r语言 数据挖掘 随机生存森林
原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzOTQzNzU0NA==&mid=2247496134&idx=1&sn=b1aa15040427e9445c2eae4108f0bf24&chksm=facac141cdbd485787d1a168c96f7295f66372d68a2623d58e2c6d8fc5b0f0e630d0ebb1a7d9&scene=21#wechat_redirect
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关于临床预测模型的基础知识，小编之前已经写过非常详细的教程，包括了临床预测模型的定义、常用评价方法、列线图、ROC曲线、IDI、NRI、校准曲线、决策曲线等。

全都是免费获取的代码和数据：R语言临床预测模型合集

临床预测模型进阶系列目前已推出随机生存森林系列推文：

医学和生信笔记
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专栏目录
一文看懂随机森林 - Random Forest（附 4 个构造步骤+10 个优缺点）
weixin_43612023的博客
08-22 1万+
本文首发自 产品经理的人工智能知识库 原文地址：《一文看懂随机森林 - Random Forest（附 4 个构造步骤+10 个优缺点）》 随机森林是一种由决策树构成的集成算法，他在很多情况下都能有不错的表现。 本文将介绍随机森林的基本概念、4 个构造步骤、4 种方式的对比评测、10 个优缺点和 4 个应用方向。 什么是随机森林？ 随机森林属于 集成学习 中的 Bagging（Bootstr...
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Eason的博客
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夏之微风的博客
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m0_71467458的博客
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在这个MATLAB实现中，`MainRFTS.m`是主要的代码文件，可能包含了随机森林模型的构建、训练、验证和预测过程。代码可能会使用`fitensemble`函数来创建随机森林模型，`predict`函数来进行预测，以及`load`函数来加载...
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随机森林用于分类matlab代码
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文章目录介绍randomForest()的用法参数介绍输出参数 介绍 randomForest 使用 Breiman 的随机森林算法(based on Breiman and Cutler’s original Fortran code)实现分类和回归。它也具有无监督模式(unsupervised mode for assessing proximities among data points). randomForest()的用法 ## S3 method for class 'formula' rand
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胖三斤吃不胖
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如何评估随机森林模型以及重要预测变量的显著性
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R语言是一种常用的统计分析软件，随机森林(Random Forest)是其中一个重要的算法。本文将介绍随机森林在R中的操作步骤及结果解读。 1.导入数据 首先，要导入需要分析的数据集。在R中，可以使用read.csv()函数、read.table()函数等函数导入数据。例如，通过以下命令导入iris数据集： data(iris) df <- iris 2.数据预处理 在导入数据后，需要对数据进行处理以满足建模需要。通常的预处理包括数据清理、数据缺失值处理和特征变量选择等。例如，可以使用na.omit()函数删除包含缺失值的行： df <- na.omit(df) 或者可以使用caret package中的preProcess()函数进行数据预处理： library(caret) pre <- preProcess(df,method="medianImpute") # 缺失值处理 3.建立模型 通过以上预处理，数据集已经可以使用随机森林进行建模。在R中，使用randomForest()函数进行建模： library(randomForest) model <- randomForest(Species~.,data=df,importance=T) 其中Species表示预测变量，"."表示选取全部特征变量。importance=T表示计算出特征变量的重要性排序。 4.模型评估 建立模型后，需要对模型进行评估，以确定模型的准确性和效果。可以使用confusionMatrix()函数计算模型的准确性和错误率： cm <- confusionMatrix(df$Species,predict(model,type="class")) cm$overall["Accuracy"] 5.结果解读 随机森林模型的输出包括变量重要性排序、误差率、变量重要性图、变量的决策树等。其中，变量重要性排序可以使用varImpPlot()函数进行可视化展示： varImpPlot(model) 变量的决策树利用rpart.plot()函数进行可视化展示： library(rpart.plot) rpart.plot(model$forest[[1]]) 以上就是R语言中随机森林操作步骤及结果解读的介绍。需要强调的是，随机森林是一种集成学习方法，通过组合多个决策树的结果来提高分类或回归的准确性，因此在使用随机森林时要注意调整决策树的参数，以及评估模型的效率。

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