python做方差分析

方差分析用于判断因素变化对实验指标的影响,包括单因素、多因素无重复和重复测量方差分析。使用Python时,依赖pandas和statsmodels库,通过DataFrame构建数据,ols函数进行线性回归,anova_lm进行方差分析。对于重复测量,需考虑正态性、方差齐性和球形检验。不满足球形假设时,可采用MANOVA或调整F值自由度。
摘要由CSDN通过智能技术生成

方差分析可以用来推断一个或多个因素在其状态变化时,其因素水平或交互作用是否会对实验指标产生显著影响。主要分为单因素方差分析、多因素无重复方差分析和多因素重复方差分析。

做方差分析首先必须满足独立,正态检验,方差齐性检验。如果是重复测量方差分析,则必须满足正态检验,方差齐性检验,以及球形检验。

之前一直使用的是SPSS,其实也可以用python或者R做方差分析

python 

主要用到的库是pandas和statsmodels。简要流程是,先用pandas库的DataFrame数据结构来构造输入数据格式。然后用statsmodels库中的ols函数得到最小二乘线性回归模型。最后用statsmodels库中的anova_lm函数进行方差分析。

#!/usr/bin/env python
# -*- coding: UTF-8 -*-

import pandas as pd
import numpy as np
from statsmodels.formula.api import ols
from statsmodels.stats.anova import anova_lm
data = pd.DataFrame([[1, 1, 32],
                     [1, 2, 35],
                     [1, 3, 35.5],
                     [1, 4, 38.5],
                     [2, 1, 33.5],
                     [2, 2, 36.5],
                     [2, 3, 38],
                     [2, 4, 39.5],
                     [3, 1, 36],
                     [3, 2, 37.5],
                     [3
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