用R语言进行样本层次聚类分析
样本层次聚类是一种常用的无监督学习方法,它可以根据样本间的相似性将它们分组成不同的类别。在R语言中,我们可以使用dist函数计算数据框中两两样本之间的距离,并使用hclust函数进行层次聚类分析。本文将介绍如何使用这两个函数来完成样本层次聚类分析,并说明method参数的作用。
首先,让我们看一下如何使用dist函数计算样本间的距离矩阵。假设我们有一个名为data的数据框,其中包含了多个样本的特征数据。我们可以使用以下代码计算样本间的距离矩阵:
# 计算样本间的距离矩阵
dist_matrix <- dist(data)
在上述代码中,dist函数接受一个数据框作为输入,并计算数据框中样本之间的欧氏距离。dist函数返回的是一个距离矩阵,其中每个元素表示对应样本之间的距离。
接下来,我们将距离矩阵输入给hclust函数进行层次聚类分析。hclust函数使用一种自底向上的策略,通过合并最近的样本来构建聚类树。我们可以使用以下代码进行聚类分析:
# 进行层次聚类分析
hclust_result <- hclust(dist_matrix, method = "complete")
在上述代码中,hclust函数接受距离矩阵作为输入&#x