用R语言进行样本层次聚类分析

用R语言进行样本层次聚类分析

样本层次聚类是一种常用的无监督学习方法，它可以根据样本间的相似性将它们分组成不同的类别。在R语言中，我们可以使用dist函数计算数据框中两两样本之间的距离，并使用hclust函数进行层次聚类分析。本文将介绍如何使用这两个函数来完成样本层次聚类分析，并说明method参数的作用。

首先，让我们看一下如何使用dist函数计算样本间的距离矩阵。假设我们有一个名为data的数据框，其中包含了多个样本的特征数据。我们可以使用以下代码计算样本间的距离矩阵：

# 计算样本间的距离矩阵
dist_matrix <- dist(data)

在上述代码中，dist函数接受一个数据框作为输入，并计算数据框中样本之间的欧氏距离。dist函数返回的是一个距离矩阵，其中每个元素表示对应样本之间的距离。

接下来，我们将距离矩阵输入给hclust函数进行层次聚类分析。hclust函数使用一种自底向上的策略，通过合并最近的样本来构建聚类树。我们可以使用以下代码进行聚类分析：

# 进行层次聚类分析
hclust_result <- hclust(dist_matrix, method = "complete")

在上述代码中，hclust函数接受距离矩阵作为输入&#x