MISAG与MIMAG：基因组质量评估标准

宏基因组数据进行分箱（binning）后，需要对得到的宏基因组组装基因组（MAG）进行质量评估。常用的工具是CheckM，主要以每个MAG的completeness与contamination来作为判断指标。

Bowers, R., Kyrpides, N., Stepanauskas, R. et al. Minimum information about a single amplified genome (MISAG) and a metagenome-assembled genome (MIMAG) of bacteria and archaea. Nat Biotechnol 35, 725–731 (2017). https://doi.org/10.1038/nbt.3893中提出了一套针对两类组装基因组的质量标准，分别称为单扩增基因组最小数据要求（Minimum Information about a Single Amplified Genome, MISAG）与宏基因组组装基因组最小数据要求（Minimum Information about a Metagenome-Assembled Genome, MIMAG）。

SAG全称Single Amplified Genome，是通过分离单个细胞利用全基因组扩增（WGA）来获得的基因组。
MAG全称Metagenome-Assembled Genome，是通过宏基因组测序后利用分箱计算得到的基因组。

本文提出了一套参考标准，用于对基因组进行分级：