代谢组数据分析三:降维分析

本文详细介绍了代谢组学中常用的降维分析方法,包括PCA、PLS-DA和OPLS-DA。PCA通过线性变换降低数据维度,便于数据可视化和异常值检测;PLS-DA是一种有监督的模式识别方法,适用于分类和预测;OPLS-DA通过正交分解避免过拟合,更准确地筛选差异代谢物。降维分析在揭示样本间差异和发现生物标志物方面具有重要意义。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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介绍

降维分析是代谢组学研究中一种重要技术,旨在揭示样本间的差异或挖掘潜在的生物标志物。在进行此类分析时,研究者通常采取以下几种方法:

主成分分析(PCA)

主成分分析(PCA)是一种广泛应用于数据分析中的降维方法。它通过线性变换技术,将原始数据转换为一组新的、各维度之间线性无关的表示形式。这种转换能够提取数据中的主要特征分量,使得研究者能够更直观地理解数据的结构,并有效应对高维数据带来的挑战。PCA在代谢组学研究中常用于数据的可视化、异常值检测和特征提取。

偏最小二乘判别分析(PLS-DA)

偏最小二乘判别分析(PLS-DA)是一种有监督的模式识别方法,特别适用于多维数据的分类和预测。在PLS-DA中,研究者首先根据已知的差异因素将数据分组,然后通过偏最小二乘回归技术对数据进行压缩和降维。这种方法能够同时考虑自变量和因变量的信息,从而提取出与分组信息最为相关的特征变量。在代谢组学研究中,PLS-DA常用于区分不同病理状态下的样本,并筛选出具有生物标志意义

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