数据分析:物种相对丰度和出现率的散点图展示物种重要性

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介绍

在微生物分析过程中,通过物种的相对丰度和出现率绘制散点图可以提供以下信息:

相对丰度Abundance

  • 定义:相对丰度是指某一物种在样本中的序列数占总序列数的比例。
  • 意义:通过相对丰度可以识别出在样本中占主导地位的物种(优势物种)以及那些相对较少的物种(稀有物种)。优势物种可能在生态系统中发挥重要作用,而稀有物种的多样性和功能也值得关注。

出现率Prevalence

  • 定义:出现率是指某一物种在多个样本中出现的频率。
  • 意义:出现率可以帮助识别那些在多个样本中普遍存在的物种,这些物种可能在生态系统中具有稳定的功能或生态位。相反,出现率低的物种可能在特定条
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