代谢组数据分析（二十三）：基于XCMS包的液相色谱-质谱（LC-MS）数据处理及分析流程

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介绍

XCMS 是一个专为处理液相色谱 - 质谱（LC/MS）和气相色谱 - 质谱（GC/MS）数据而设计的 R 包，在代谢组学研究领域发挥着极为重要的作用，尤其是在代谢物的定性和定量分析方面。其作用主要体现在能够从复杂的原始质谱数据中高效、精准地提取和量化特征，为后续深入的生物学研究提供数据基础。以下是 XCMS 包涵盖的多个关键步骤及其处理质谱数据的具体方式：

• 数据读取：XCMS 包具备强大的数据读取功能，能够兼容多种常见的质谱数据格式，如 mzXML、mzData 和 mzML 等。通过特定的函数，可轻松将原始数据导入 R 环境，为后续的数据处理和分析做好准备。

• 预处理：此步骤主要对读取的数据进行噪声过滤、基线校正等操作，以提高数据质量。XCMS 包通过一系列算法，去除数据中的背景噪声和基线漂移，使得后续分析结果更加准确可靠。<