20230419 生物基础学习- 氨基酸-密码子-突变

名称

Phenylalanine,Leucine,Isoleucine,Methionine,Valine,Serine,Proline,Threonine,Alanine,Tyrosine,Histidine,Glutamine,Asparagine,Lysine,Aspartic acid,Glutamic acid,Cysteine,Tryptophan,Arginine,Glycine

24种氨基酸缩写及其理化性质 https://www.jianshu.com/p/7a3e93b15cfd

中文名称	英文名称	短写	缩写
丙氨酸	Alanine	A	Ala
苯丙氨酸	Phenylalanine	F	Phe
半胱氨酸	Cysteine	C	Cys
硒半胱氨酸*	Selenocysteine	U	Sec
天冬氨酸	Aspartic acid / Aspartate	D	Asp
天冬酰胺	Asparagine	N	Asn
谷氨酸	Glutamic acid / Glutamate	E	Glu
谷氨酰胺	Glutamine	Q	Gln
甘氨酸	Glycine	G	Gly
组氨酸	Histidine	H	His
亮氨酸	Leucine	L	Leu
异亮氨酸	Isoleucine	I	Ile
离氨酸	Lysine	K	Lys
吡咯赖氨酸*	Pyrrolysine	O	Pyl
蛋氨酸	Methionine	M	Met
脯氨酸	Proline	P	Pro
精氨酸	Arginine	R	Arg
丝氨酸	Serine	S	Ser
苏氨酸	Threonine	T	Thr
缬氨酸	Valine	V	Val
色氨酸	Tryptophan	W	Trp
酪氨酸	Tyrosine	Y	Tyr

形状

密码子-氨基酸对应表

简明中文

英文和简称

Here is the standard genetic code chart in English:

UUU / UUC: Phenylalanine (Phe)

UUA / UUG: Leucine (Leu)

CUU / CUC / CUA / CUG: Leucine (Leu)

AUU / AUC / AUA: Isoleucine (Ile)

AUG: Methionine (Met) - Start codon

GUU / GUC / GUA / GUG: Valine (Val)

UCU / UCC / UCA / UCG: Serine (Ser)

CCU / CCC / CCA / CCG: Proline (Pro)

ACU / ACC / ACA / ACG: Threonine (Thr)

GCU / GCC / GCA / GCG: Alanine (Ala)

UAU / UAC: Tyrosine (Tyr)

UAA / UAG / UGA: Stop codon

CAU / CAC: Histidine (His)

CAA / CAG: Glutamine (Gln)

AAU / AAC: Asparagine (Asn)

AAA / AAG: Lysine (Lys)

GAU / GAC: Aspartic acid (Asp)

GAA / GAG: Glutamic acid (Glu)

UGU / UGC: Cysteine (Cys)

UGG: Tryptophan (Trp)

CGU / CGC / CGA / CGG: Arginine (Arg)

AGU / AGC: Serine (Ser)

AGA / AGG: Arginine (Arg)

GGU / GGC / GGA / GGG: Glycine (Gly)

突变类型

生物化学课程笔记

课程链接 ： https://www.youtube.com/watch?v=CHJsaq2lNjU&list=PLybg94GvOJ9Fazvaf8unWl9J2soXCAvy4

特殊氨基酸的性质

缬氨酸和甲硫氨酸

1. 在正常情况下，缬氨酸（amber）和甲硫氨酸（ochre）并不作为一般意义上的氨基酸参与到多肽链中。但在某些情况下，这些两种氨基酸会替代常规的终止密码子UAA和UGA参与到蛋白质合成的过程中，这被称之为“非典型的转录终止”。这种现象主要发生在病毒、菌类和一些原生动物等组织中。
   研究显示，这种非典型转录终止更容易发生在病毒基因组RNA的编码区，因为病毒不需要遵守宿主细胞的识别规则。而在其他生物中，这种现象极为罕见，也只有在一些突变的基因中才会发现。此外，在某些原核生物和植物中，琥珀酸也可以被用作那些缺少UAG密码子的物种，这种情况通常只发生在特定的基因和环境条件下。
2. 除了常见的“终止密码子”，即UAA、UAG和UGA，缬氨酸和甲硫氨酸是两种被用作终止密码子的罕见氨基酸。此外，在一些特殊情况下，其他氨基酸也可以被用作终止密码子，但这种情况比较少见。例如，在某些植物和原核生物中，琥珀酸（葡萄糖酸）被用作终止密码子，这是因为这些生物缺少UAG密码子。需要注意的是，使用缬氨酸和甲硫氨酸作为终止密码子的情况在不同生物中的频率和原因也有所不同。
3. 缬氨酸是一种具有较高反应性的氨基酸，也因此比较容易导致蛋白质结构的不稳定，进而影响蛋白的结构和功能。因此，终止密码子UAG的出现，可以避免由于缬氨酸的出现而导致蛋白质发生异常折叠的现象，从而维护生命的正常运转。"

染色体 - RNA - 蛋白质

1. 在genbank查询染色体序列: genome data viewer
   https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/nucleotide/?id=NM_152756.5
   左上框可以定位突变的位置，右下框就在染色体上显示
2. 箭头的方向表示翻译的方向，可能有剪切跳过的地方