生信技能35 - WisecondorX多分辨率CNV检测的程序封装

生信与基因组学

于 2024-01-13 12:25:58 发布

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分类专栏：生信分析项目实战技能合集文章标签： python 前端开发语言

本文链接：https://blog.csdn.net/LittleComputerRobot/article/details/135568181

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本文介绍了如何使用WisecondorX进行拷贝数变异(CNV)分析，包括配置文件的设置、Python脚本`analysisCNV.py`的封装以及运行示例。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

WisecondorX软件基本用法

参考本人以下文章，进行参考reference的构建。

生信软件4 - 拷贝数变异CNV分析软件 WisecondorX

1. 配置文件

文件名称config.ini ，包含参考reference各分辨率检测对应的参考文件

[reference]
reference_20kb = /reference/reference_20k.npz
reference_100kb = /reference/reference_100k.npz
reference_200kb = /reference/reference_200k.npz

2. CNV calling 脚本封装

程序为python编写，

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