生信分析进阶12 - 外显子测序及捕获测序质控点

1. 原始下机数据量（单位Gb）

查看测序仪生成的原始数据文件大小，数据量大小直接影响后续分析的准确性和可靠性，足够的数据量是获得可靠结果的基础。

通常，测序仪在完成测序后会生成特定格式的文件（如 FASTQ 格式），通过查看这些文件的大小来确定原始数据量。在 Linux 系统中使用ls -lh命令查看文件大小。

2. 捕获区域大小（设计区域大小，单位Mb）

捕获区域大小决定了能够检测到的基因组范围，对于目标区域的研究至关重要。参考捕获试剂盒的说明书，其中会明确给出设计的捕获区域大小。

3. 接头Adapter 比例

较高的 adapter 比例可能会影响后续的比对和分析，需要在数据预处理阶段进行处理（如使用 cutadapt 、trim-galore、Trimmomatic等工具去除 Adapter）。使用 FastQC 等质量控制工具对原始 FASTQ 数据进行分析， 可生成详细的质控报告，其中包括 adapter 含量的统计信息。

4. 测序质量（