单细胞Seurat标准分析流程R语言封装

单细胞Seurat标准分析流程R语言封装

  1. 数据预处理与质控(线粒体基因比例计算、QC图表生成)
  2. 标准化与高变基因筛选
  3. PCA/UMAP降维与聚类分析 差异表达分析模块
  4. 自动化输出PNG可视化图表(质控小提琴图、UMAP聚类图)
  5. 结果将保存在results/和figures/目录下(RDS对象、差异基因CSV表格)

R语言分析方法

# scRAN.R
# 单细胞测序标准分析流程
# 依赖包安装检查
if (!requireNamespace('BiocManager', quietly 
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生信与基因组学

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