全网最全 | R语言中的方差分析汇总

方差分析是一个全新的思路，它采用的是变异分解的思路，将组内组件分开，查看显著性。

变异分解，和数量遗传学的创立也密不可分，比如

表型 = 基因+ 环境

更进一步：表型 = 加性效应 + 非加性效应 + 环境

更更进一步：表型 = 加性效应 + 显性效应 + 上位性效应 + 环境

育种值是加性效应的部分

杂种优势是显性和上位性效应的部分

基因与环境互作是：环境*基因的效应

另外还有重复力效应（个体永久环境效应）、母体效应、窝别效应等等，都是使用表型数据剖分的形式进行计算和评估。

很多人分析数据，想看一下显著性与否，显著的话就说明有差异，具体差异是多少，需要进行多重比较。所以，先要有方差分析，才有显著性，只有显著了，才可以进行多重比较。先后顺序不能错。

方差分析，还有一定的前提假定。需要进行检验。

方差分析后，多重比较也有很多方法。

好在，现在的R语言足够友好，各种功能都已经打包好了，直接拿来用就行了。

下面看我的总结：