CNS级别的高级气泡图——R语言简单实现

气泡图大家平时比较常见，其实就是将数值大小映射到气泡的大小上，使用R语言做气泡图非常的简单，今天我们教大家来学习一下气泡图的R语言画法。

教程讲解

1.加载需要的R包

library(openxlsx)
library(tidyverse)

2.数据介绍，就是一般的GO富集分析结果，每一列代表一种类型的数据

• Category包括三个变量，分别是BP，CC，MF，接触过组学的同学都懂

• GOID就是GO术语的ID

• 其他列看第一列就明白意思了

3.读取数据

data <- read.xlsx("GO_气泡图.xlsx")

4.使用ggplot2进行作图

• 将Category映射到shape，用不同的形状表示不同的生物过程

• 将padj映射到colour

• 将Count映射到size，更加明显看到节点的大小

ggplot(data,aes(Count,Description,
               shape=Category,
               colour=padj,
               size=Count))+
 geom_point()

5.进一步的对图形进行美化

• 使用wind