在质粒合成过程中,怎么查找目的蛋白的CDS序列

在蛋白表达纯化实验中,我们首先要找到自己实验所需的目的蛋白的质粒,一般有几种获取方式:

1.addgene官网上查询是否有开源共享的质粒

2.已经发表文章所用到的质粒,我们可以邮箱联系作者,看作者是否愿意共享

3.自己设计质粒,自己构建,或者找公司合成质粒,但在质粒设计中,往往先需要找到目的蛋白的CDS序列,下面将分享如何获取目的基因的CDS序列

方法:NCBI中寻找目的基因的CDS序列

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在NCBI中选择Gene,输入P53

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在人中为TP53

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在右侧选择RefSeq数据库

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点击NM_000546.6检索号

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然后下拉找到CDS序列

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点击最下方的FASTA文件

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把序列粘贴至Snapgene中,新建一个序列

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得到新建的序列

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得到新建序列后,我们就可以根据序列设计相应的引物,再插入相应的质粒中即可。
 

文章转载自公众号:皮蛋笔记,欢迎关注,随时获取第一手文章内容。

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