HMDD 4.0：miRNA-疾病关系数据库

拥有多项自主专利技

术和软件著作权，具

有丰富的数据库平台

搭建经验。

凌恩-盈飞团队

MicroRNA（miRNA）是一类重要的小非编码RNA，在疾病诊断和治疗中发挥着重要作用。人类 MicroRNA 疾病数据库 (HMDD) 为 miRNA 相关医学提供了重要且全面的资源。与HMDD v3.0 相比，HMDD v4.0 包含的条目数量增加了 1.5 倍，增加了一些新的类别（与疾病有关的外泌体 miRNA、与人类疾病有关的病毒编码的 miRNA 以及 miRNA-circRNA 相互作用的条目），还在疾病中筛选了性别偏向的miRNA。

数据库可免费访问http://www.cuilab.cn/hmdd。

图1 图形摘要

HMDD v4.0包含53530个实验支持的miRNA-疾病关联条目，涵盖了来自37090篇论文的1817个人类miRNA基因，79个病毒源性miRNA和2360个人类疾病。根据实验证据，这些条目被分为8类，包括23种不同的证据代码。此外，研究还将来自不同疾病的性别偏向的miRNA纳入HMDD v4.0中，以促进对疾病性别差异的理解。

图2 HMDD v4.0数据库概述

与其他类似数据库相比，HMDD v4.0增加了更大数量的miRNA-疾病关联、详细的关联类别和方便的功能模块。

表 HMDD v4.0与其他类似数据库的比较

总之，HMDD的不断更新，为研究miRNA-疾病关系网络提供了一个重要而有用的资源。

Tips

凌恩-盈飞团队，致力于开拓前沿分子生物学技术和高性能计算在生命科学研究、分子育种及人类健康领域的应用，旨在为生命科学领域客户提供国际领先的数据管理和分析解决方案。公司拥有多项自主专利技术和软件著作权，成功开发VG多样性分析软件、VG转录组分析软件、VG生信分析云平台、R J肿瘤信息 管理系统（临床应用）、Y-STR/Y-SNP法医学分析平台（法医应用）、FD个人基因组分析和报告系统、FD祖源分析和报告系统、FD家系分析和报告系统、动植物物种数据库（水稻、蕨类、瓠瓜、旱獭、桉树等 ）、TMBQ 靶向代谢组批量定量分析平台、蛋白代谢数据分析平台等。客户群体包括高等院校、科研院所、三甲医院及疾控中心，药企及基因检测公司等。

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参考文献

HMDD v4.0: a database for experimentally supported human microRNA-disease associations. Nucleic Acids Research, 2023.